Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G291800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YS52
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.004G291800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G020401 - -
2 Sobic.009G197200 - -
3 Sobic.009G110366 - -
4 Sobic.002G212800 - -
5 Sobic.007G112900 - -
6 Sobic.009G109450 - -
7 Sobic.007G130100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G273100 - -
9 Sobic.003G057800 rho termination factor, N-terminal domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G046000 - -
11 Sobic.008G091671 - -
12 Sobic.008G079100 - -
13 Sobic.009G180200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
14 Sobic.005G121800 expressed protein -
15 Sobic.007G132600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MYB family transcription factor, putative, expressed -
16 Sobic.004G143700 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
17 Sobic.005G099150 - -
18 Sobic.009G257300 ELF3 protein, putative, expressed K12125: protein EARLY FLOWERING 3
19 Sobic.003G159450 - -
20 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic004G291800--Sobic004G020401 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G197200 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic004G291800--Sobic009G110366 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic004G291800--Sobic002G212800 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic004G291800--Sobic007G112900 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic004G291800--Sobic009G109450 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic004G291800--Sobic007G130100 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic004G291800--Sobic006G273100 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic004G291800--Sobic003G057800 Sobic004G020401--Sobic004G291800 Sobic004G020401--Sobic009G110366 Sobic004G020401--Sobic009G109450 Sobic004G020401--Sobic009G197200 Sobic004G020401--Sobic003G057800 Sobic004G020401--Sobic007G130100 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic004G020401--Sobic001G479500 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic004G020401--Sobic003G357500 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic004G020401--Sobic008G161401 Sobic009G197200--Sobic004G291800 Sobic009G197200--Sobic004G020401 Sobic009G197200--Sobic009G110366 Sobic009G197200--Sobic009G109450 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic006G273100 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic009G197200--Sobic008G091671 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic002G212800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic009G110366--Sobic007G073400 Sobic009G110366--Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic009G109450 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic003G258400 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G110366--Sobic006G196000 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G291800 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G110366--Sobic009G180200 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic009G110366--Sobic009G198900 Sobic002G212800--Sobic007G112900 Sobic002G212800--Sobic004G291800 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic002G212800--Sobic006G046000 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic002G212800--Sobic003G159450 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic002G212800--Sobic006G048775 Sobic002G212800--Sobic009G197200 Sobic002G212800--Sobic008G091671 Sobic002G212800--Sobic009G110366 Sobic002G212800--Sobic004G020401 Sobic007G112900--Sobic002G212800 Sobic007G112900--Sobic003G159450 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic007G112900--Sobic010G143200 Sobic007G112900--Sobic004G291800 Sobic007G112900--Sobic006G046000 Sobic001G394400 Sobic001G394400 Sobic007G112900--Sobic001G394400 Sobic007G112900--Sobic008G091671 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic007G112900--Sobic008G125600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G112900--Sobic009G104300 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic009G109450--Sobic009G078500 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic009G180200 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic009G109450--Sobic005G130100 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic006G196000 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic009G109450--Sobic005G121800 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic009G110366 Sobic007G130100--Sobic004G020401 Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic007G130100--Sobic004G315800 Sobic007G130100--Sobic004G291800 Sobic003G324000 Sobic003G324000 Sobic007G130100--Sobic003G324000 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic007G130100--Sobic010G280100 Sobic007G130100--Sobic009G198900 Sobic007G130100--Sobic003G057800 Sobic007G130100--Sobic006G048775 Sobic007G130100--Sobic009G110366 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G273100--Sobic009G113600 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic006G273100--Sobic002G051400 Sobic006G273100--Sobic009G109450 Sobic006G273100--Sobic009G110366 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic006G273100--Sobic009G196700 Sobic006G273100--Sobic005G121800 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G273100--Sobic008G079100 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic006G273100--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic006G273100--Sobic008G108900 Sobic003G057800--Sobic001G479500 Sobic003G057800--Sobic003G357500 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic003G057800--Sobic010G248200 Sobic003G057800--Sobic008G161401 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G057800--Sobic004G212800 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic003G057800--Sobic005G130200 Sobic003G057800--Sobic007G073400 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic003G057800--Sobic004G016500 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G057800--Sobic001G046600
Octagon: transcription factors


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