Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G153000.1,Sobic.010G153000.2
Synonym Sb10g020510
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z3M1 , A0A194YJD4
Pfam -
Panther DB PTHR38353
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G33500 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g23140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004097
Brachypodium KQJ96068
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G262700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
2 Sobic.007G118075 - -
3 Sobic.002G011100 expressed protein -
4 Sobic.009G116400 pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G089500 - -
7 Sobic.001G204700 expressed protein -
8 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
9 Sobic.006G028700 expressed protein -
10 Sobic.003G177800 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G019750 - -
12 Sobic.005G123400 expressed protein -
13 Sobic.002G019500 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G141600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@vegetative storage protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
16 Sobic.008G036400 expressed protein -
17 Sobic.006G224300 APO, putative, expressed -
18 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
19 Sobic.009G000400 expressed protein -
20 Sobic.001G187800 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase


Gene co-expression network
sample Sobic010G153000 Sobic010G153000 Sobic006G262700 Sobic006G262700 Sobic010G153000--Sobic006G262700 Sobic007G118075 Sobic007G118075 Sobic010G153000--Sobic007G118075 Sobic002G011100 Sobic002G011100 Sobic010G153000--Sobic002G011100 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic010G153000--Sobic009G116400 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic010G153000--Sobic005G154700 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic010G153000--Sobic004G089500 Sobic001G204700 Sobic001G204700 Sobic010G153000--Sobic001G204700 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic010G153000--Sobic003G397100 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic010G153000--Sobic006G028700 Sobic006G262700--Sobic009G116400 Sobic001G242300 Sobic001G242300 Sobic006G262700--Sobic001G242300 Sobic009G155400 Sobic009G155400 Sobic006G262700--Sobic009G155400 Sobic008G163400 Sobic008G163400 Sobic006G262700--Sobic008G163400 Sobic004G256900 Sobic004G256900 Sobic006G262700--Sobic004G256900 Sobic010G068900 Sobic010G068900 Sobic006G262700--Sobic010G068900 Sobic010G190900 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Octagon: transcription factors


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