Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G141600.1
Synonym MEF22, Sb04g017510
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
vegetative storage protein, putative, expressed
UniProt A0A194YPL5
Pfam PF12854 PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF498
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12770 : mitochondrial editing factor 22
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g26940.1 : vegetative storage protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032402 , Zm00025a020305
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G478900 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.002G108100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G155400 ankyrin, putative, expressed -
4 Sobic.002G106200 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G171700 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G342500 methyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.003G142400 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.007G048900 OsFBX381 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G106600 - -
10 Sobic.010G277700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@IPP transferase, putative, expressed K00791: miaA, tRNA dimethylallyltransferase
11 Sobic.010G153000 expressed protein -
12 Sobic.004G051600 EMB2758, putative, expressed -
13 Sobic.006G167100 - -
14 Sobic.001G414100 expressed protein -
15 Sobic.001G023600 YIF1B, putative, expressed -
16 Sobic.003G057050 - -
17 Sobic.006G220400 exonuclease, putative, expressed -
18 Sobic.007G118075 - -
19 Sobic.008G095900 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
20 Sobic.003G333200 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G141600 Sobic004G141600 Sobic001G478900 Sobic001G478900 Sobic004G141600--Sobic001G478900 Sobic002G108100 Sobic002G108100 Sobic004G141600--Sobic002G108100 Sobic008G155400 Sobic008G155400 Sobic004G141600--Sobic008G155400 Sobic002G106200 Sobic002G106200 Sobic004G141600--Sobic002G106200 Sobic005G171700 Sobic005G171700 Sobic004G141600--Sobic005G171700 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic004G141600--Sobic003G342500 Sobic003G142400 Sobic003G142400 Sobic004G141600--Sobic003G142400 Sobic007G048900 Sobic007G048900 Sobic004G141600--Sobic007G048900 Sobic007G106600 Sobic007G106600 Sobic004G141600--Sobic007G106600 Sobic008G095900 Sobic008G095900 Sobic001G478900--Sobic008G095900 Sobic006G262800 Sobic006G262800 Sobic001G478900--Sobic006G262800 Sobic004G256900 Sobic004G256900 Sobic001G478900--Sobic004G256900 Sobic003G184300 Sobic003G184300 Sobic001G478900--Sobic003G184300 Sobic009G047700 Sobic009G047700 Sobic001G478900--Sobic009G047700 Sobic004G051600 Sobic004G051600 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Octagon: transcription factors


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