Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G106600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PH14
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G108100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G189000 - -
3 Sobic.001G135700 - -
4 Sobic.007G141600 ZOS8-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
5 Sobic.001G478900 pentatricopeptide, putative, expressed -
6 Sobic.006G265800 OsFBX154 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G095900 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
8 Sobic.004G194400 expressed protein -
9 Sobic.009G163100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10403: kinesin family member 22
10 Sobic.007G063800 - -
11 Sobic.010G123100 transporter-related, putative, expressed -
12 Sobic.003G342500 methyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.003G057050 - -
14 Sobic.008G007600 - -
15 Sobic.008G156600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
16 Sobic.004G038400 fruit bromelain precursor, putative, expressed -
17 Sobic.009G047700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed -
18 Sobic.001G435700 HVA22, putative, expressed K17338: receptor expression-enhancing protein 1/2/3/4
19 Sobic.008G171900 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
20 Sobic.006G071362 - K02021: putative ABC transport system ATP-binding protein


Gene co-expression network
sample Sobic007G106600 Sobic007G106600 Sobic002G108100 Sobic002G108100 Sobic007G106600--Sobic002G108100 Sobic004G189000 Sobic004G189000 Sobic007G106600--Sobic004G189000 Sobic001G135700 Sobic001G135700 Sobic007G106600--Sobic001G135700 Sobic007G141600 Sobic007G141600 Sobic007G106600--Sobic007G141600 Sobic001G478900 Sobic001G478900 Sobic007G106600--Sobic001G478900 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic007G106600--Sobic006G265800 Sobic008G095900 Sobic008G095900 Sobic007G106600--Sobic008G095900 Sobic004G194400 Sobic004G194400 Sobic007G106600--Sobic004G194400 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic007G106600--Sobic009G163100 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic002G108100--Sobic003G342500 Sobic008G155400 Sobic008G155400 Sobic002G108100--Sobic008G155400 Sobic005G045800 Sobic005G045800 Sobic002G108100--Sobic005G045800 Sobic009G066200 Sobic009G066200 Sobic002G108100--Sobic009G066200 Sobic003G200000 Sobic003G200000 Sobic002G108100--Sobic003G200000 Sobic003G352900 Sobic003G352900 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Octagon: transcription factors


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