Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G095900.1,Sobic.008G095900.5,Sobic.008G095900.4,Sobic.008G095900.7
Synonym Sb08g014300
Functional annotation ATP binding protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PCK0 , A0A1Z5R5P8 , A0A1Z5R6M6 , A0A1B6PCQ3
Pfam -
Panther DB PTHR32387 PTHR32387:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology K17592; sacsin
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48770 : DNA binding;ATP binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g29350.1 : ATP binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017695
Brachypodium PNT62719 , PNT62721 , PNT62720
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G194400 expressed protein -
2 Sobic.001G308500 glycosyltransferase family protein 1, putative, expressed -
3 Sobic.004G051600 EMB2758, putative, expressed -
4 Sobic.001G478900 pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.008G085950 - -
6 Sobic.006G191000 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
7 Sobic.010G086300 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
8 Sobic.006G071362 - K02021: putative ABC transport system ATP-binding protein
9 Sobic.003G004800 ATP binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G274800 glycosyl transferase family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
11 Sobic.004G215600 - K15271: HFM1, ATP-dependent DNA helicase HFM1/MER3
12 Sobic.001G385000 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K14641: apyrase
13 Sobic.002G362500 expressed protein -
14 Sobic.001G149000 FAR1 family protein, expressed -
15 Sobic.004G025700 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G123100 transporter-related, putative, expressed -
17 Sobic.006G265800 OsFBX154 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G486900 exostosin family protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G057050 - -
20 Sobic.008G152700 expressed protein K07541: GPI mannosyltransferase 1 subunit X


Gene co-expression network
sample Sobic008G095900 Sobic008G095900 Sobic004G194400 Sobic004G194400 Sobic008G095900--Sobic004G194400 Sobic001G308500 Sobic001G308500 Sobic008G095900--Sobic001G308500 Sobic004G051600 Sobic004G051600 Sobic008G095900--Sobic004G051600 Sobic001G478900 Sobic001G478900 Sobic008G095900--Sobic001G478900 Sobic008G085950 Sobic008G085950 Sobic008G095900--Sobic008G085950 Sobic006G191000 Sobic006G191000 Sobic008G095900--Sobic006G191000 Sobic010G086300 Sobic010G086300 Sobic008G095900--Sobic010G086300 Sobic006G071362 Sobic006G071362 Sobic008G095900--Sobic006G071362 Sobic003G004800 Sobic003G004800 Sobic008G095900--Sobic003G004800 Sobic004G194400--Sobic006G071362 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic004G194400--Sobic006G134500 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic004G194400--Sobic006G265800 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic004G194400--Sobic003G428000 Sobic010G277700 Sobic010G277700 Sobic004G194400--Sobic010G277700 Sobic004G194400--Sobic001G308500 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic004G194400--Sobic001G149000 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic004G194400--Sobic003G385300 Sobic010G274800 Sobic010G274800 Sobic004G194400--Sobic010G274800 Sobic001G308500--Sobic006G265800 Sobic001G308500--Sobic008G085950 Sobic001G385300 Sobic001G385300 Sobic001G308500--Sobic001G385300 Sobic009G201000 Sobic009G201000 Sobic001G308500--Sobic009G201000 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic001G308500--Sobic003G352900 Sobic001G308500--Sobic010G274800 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic001G308500--Sobic009G163100 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic001G308500--Sobic004G298600 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic001G308500--Sobic008G166100 Sobic003G057050 Sobic003G057050 Sobic004G051600--Sobic003G057050 Sobic002G362500 Sobic002G362500 Sobic004G051600--Sobic002G362500 Sobic004G051600--Sobic008G095900 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic004G051600--Sobic002G414800 Sobic004G051600--Sobic008G166100 Sobic004G051600--Sobic001G308500 Sobic004G051600--Sobic009G163100 Sobic006G219801 Sobic006G219801 Sobic004G051600--Sobic006G219801 Sobic004G051600--Sobic006G071362 Sobic001G478900--Sobic008G095900 Sobic006G262800 Sobic006G262800 Sobic001G478900--Sobic006G262800 Sobic004G256900 Sobic004G256900 Sobic001G478900--Sobic004G256900 Sobic003G184300 Sobic003G184300 Sobic001G478900--Sobic003G184300 Sobic009G047700 Sobic009G047700 Sobic001G478900--Sobic009G047700 Sobic001G478900--Sobic004G051600 Sobic010G068900 Sobic010G068900 Sobic001G478900--Sobic010G068900 Sobic009G253101 Sobic009G253101 Sobic001G478900--Sobic009G253101 Sobic010G123100 Sobic010G123100 Sobic001G478900--Sobic010G123100 Sobic008G085950--Sobic001G308500 Sobic007G043700 Sobic007G043700 Sobic008G085950--Sobic007G043700 Sobic007G102000 Sobic007G102000 Sobic008G085950--Sobic007G102000 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic008G085950--Sobic007G105700 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic008G085950--Sobic003G194800 Sobic008G047500 Sobic008G047500 Sobic008G085950--Sobic008G047500 Sobic008G085950--Sobic001G385300 Sobic001G327100 Sobic001G327100 Sobic008G085950--Sobic001G327100 Sobic005G060100 Sobic005G060100 Sobic008G085950--Sobic005G060100 Sobic006G191000--Sobic010G086300 Sobic006G191000--Sobic001G149000 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic006G191000--Sobic003G394500 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic006G191000--Sobic008G152700 Sobic006G191000--Sobic004G194400 Sobic006G232800 Sobic006G232800 Sobic006G191000--Sobic006G232800 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic006G191000--Sobic009G046900 Sobic006G191000--Sobic010G274800 Sobic002G304700 Sobic002G304700 Sobic006G191000--Sobic002G304700 Sobic001G385000 Sobic001G385000 Sobic010G086300--Sobic001G385000 Sobic010G086300--Sobic006G232800 Sobic010G086300--Sobic003G394500 Sobic010G086300--Sobic001G149000 Sobic008G022400 Sobic008G022400 Sobic010G086300--Sobic008G022400 Sobic009G025700 Sobic009G025700 Sobic010G086300--Sobic009G025700 Sobic010G086300--Sobic002G362500 Sobic010G086300--Sobic006G191000 Sobic010G086300--Sobic009G046900 Sobic006G071362--Sobic004G194400 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic006G071362--Sobic003G358600 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic006G071362--Sobic001G340800 Sobic006G071362--Sobic006G134500 Sobic006G117700 Sobic006G117700 Sobic006G071362--Sobic006G117700 Sobic002G233600 Sobic002G233600 Sobic006G071362--Sobic002G233600 Sobic010G134650 Sobic010G134650 Sobic006G071362--Sobic010G134650 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic006G071362--Sobic003G024100 Sobic006G071362--Sobic006G265800 Sobic007G086600 Sobic007G086600 Sobic003G004800--Sobic007G086600 Sobic003G004800--Sobic006G265800 Sobic003G004800--Sobic001G385300 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic003G004800--Sobic001G076600 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic003G004800--Sobic003G293400 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic003G004800--Sobic010G153400 Sobic003G004800--Sobic001G308500 Sobic001G117900 Sobic001G117900 Sobic003G004800--Sobic001G117900 Sobic003G004800--Sobic005G060100
Octagon: transcription factors


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