Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G051600.1
Synonym
Functional annotation EMB2758, putative, expressed
UniProt A0A194YMT2
Pfam PF13041 PF01535
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF472
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G21065 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g06880.1 : EMB2758, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034799 , Zm00025a039668
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G015630.7 , HORVU0Hr1G015630.6 , HORVU0Hr1G015630.5 , HORVU0Hr1G015630.4 , HORVU0Hr1G015630.3 , HORVU0Hr1G015630.2 , HORVU0Hr1G015630.1 , HORVU0Hr1G015630.9 , HORVU0Hr1G015630.8 , HORVU0Hr1G015630.19 , HORVU0Hr1G015630.16 , HORVU0Hr1G015630.14 , HORVU0Hr1G015630.10 , HORVU0Hr1G015630.20 , HORVU0Hr1G015630.18 , HORVU0Hr1G015630.17 , HORVU0Hr1G015630.15 , HORVU0Hr1G015630.13 , HORVU0Hr1G015630.12 , HORVU0Hr1G015630.11
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G057050 - -
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19 Sobic.004G189000 - -
20 Sobic.004G194400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G051600 Sobic004G051600 Sobic003G057050 Sobic003G057050 Sobic004G051600--Sobic003G057050 Sobic002G362500 Sobic002G362500 Sobic004G051600--Sobic002G362500 Sobic008G095900 Sobic008G095900 Sobic004G051600--Sobic008G095900 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic004G051600--Sobic002G414800 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic004G051600--Sobic008G166100 Sobic001G308500 Sobic001G308500 Sobic004G051600--Sobic001G308500 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic004G051600--Sobic009G163100 Sobic006G219801 Sobic006G219801 Sobic004G051600--Sobic006G219801 Sobic006G071362 Sobic006G071362 Sobic004G051600--Sobic006G071362 Sobic003G057050--Sobic002G362500 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic003G057050--Sobic007G039200 Sobic003G057050--Sobic004G051600 Sobic003G057050--Sobic002G414800 Sobic003G057050--Sobic008G166100 Sobic003G349900 Sobic003G349900 Sobic003G057050--Sobic003G349900 Sobic003G057050--Sobic009G163100 Sobic008G156600 Sobic008G156600 Sobic003G057050--Sobic008G156600 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic003G057050--Sobic002G389600 Sobic001G322400 Sobic001G322400 Sobic002G362500--Sobic001G322400 Sobic001G072000 Sobic001G072000 Sobic002G362500--Sobic001G072000 Sobic009G201000 Sobic009G201000 Sobic002G362500--Sobic009G201000 Sobic002G362500--Sobic008G166100 Sobic002G362500--Sobic007G039200 Sobic002G362500--Sobic009G163100 Sobic004G113600 Sobic004G113600 Sobic002G362500--Sobic004G113600 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic002G362500--Sobic001G387300 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic002G362500--Sobic004G074900 Sobic004G194400 Sobic004G194400 Sobic008G095900--Sobic004G194400 Sobic008G095900--Sobic001G308500 Sobic008G095900--Sobic004G051600 Sobic001G478900 Sobic001G478900 Sobic008G095900--Sobic001G478900 Sobic008G085950 Sobic008G085950 Sobic008G095900--Sobic008G085950 Sobic006G191000 Sobic006G191000 Sobic008G095900--Sobic006G191000 Sobic010G086300 Sobic010G086300 Sobic008G095900--Sobic010G086300 Sobic008G095900--Sobic006G071362 Sobic003G004800 Sobic003G004800 Sobic008G095900--Sobic003G004800 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic002G414800--Sobic001G384200 Sobic002G414800--Sobic008G166100 Sobic001G280500 Sobic001G280500 Sobic002G414800--Sobic001G280500 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic002G414800--Sobic006G265800 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic002G414800--Sobic006G134500 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic002G414800--Sobic001G400000 Sobic004G007400 Sobic004G007400 Sobic002G414800--Sobic004G007400 Sobic002G414800--Sobic001G387300 Sobic002G414800--Sobic002G362500 Sobic008G166100--Sobic001G384200 Sobic008G166100--Sobic007G039200 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic008G166100--Sobic009G178400 Sobic008G166100--Sobic001G322400 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic008G166100--Sobic003G024100 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic008G166100--Sobic009G202000 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic008G166100--Sobic001G340800 Sobic008G166100--Sobic001G387300 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic008G166100--Sobic001G432200 Sobic001G308500--Sobic006G265800 Sobic001G308500--Sobic008G085950 Sobic001G385300 Sobic001G385300 Sobic001G308500--Sobic001G385300 Sobic001G308500--Sobic009G201000 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic001G308500--Sobic003G352900 Sobic010G274800 Sobic010G274800 Sobic001G308500--Sobic010G274800 Sobic001G308500--Sobic009G163100 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic001G308500--Sobic004G298600 Sobic001G308500--Sobic008G166100 Sobic009G163100--Sobic008G156600 Sobic005G020600 Sobic005G020600 Sobic009G163100--Sobic005G020600 Sobic008G171900 Sobic008G171900 Sobic009G163100--Sobic008G171900 Sobic009G163100--Sobic001G072000 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic009G163100--Sobic002G299500 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic009G163100--Sobic005G050400 Sobic001G435700 Sobic001G435700 Sobic009G163100--Sobic001G435700 Sobic001G112600 Sobic001G112600 Sobic009G163100--Sobic001G112600 Sobic009G163100--Sobic001G322400 Sobic006G219801--Sobic004G051600 Sobic010G181701 Sobic010G181701 Sobic006G219801--Sobic010G181701 Sobic006G219801--Sobic004G298600 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic006G219801--Sobic001G457500 Sobic009G047066 Sobic009G047066 Sobic006G219801--Sobic009G047066 Sobic002G339666 Sobic002G339666 Sobic006G219801--Sobic002G339666 Sobic006G219801--Sobic001G385300 Sobic006G219801--Sobic009G163100 Sobic010G123100 Sobic010G123100 Sobic006G219801--Sobic010G123100 Sobic006G071362--Sobic004G194400 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic006G071362--Sobic003G358600 Sobic006G071362--Sobic001G340800 Sobic006G071362--Sobic006G134500 Sobic006G117700 Sobic006G117700 Sobic006G071362--Sobic006G117700 Sobic002G233600 Sobic002G233600 Sobic006G071362--Sobic002G233600 Sobic010G134650 Sobic010G134650 Sobic006G071362--Sobic010G134650 Sobic006G071362--Sobic003G024100 Sobic006G071362--Sobic006G265800
Octagon: transcription factors


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