Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G007600.1
Synonym ATSWC6, SEF, Sb08g000775
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PAQ1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37055 : HIT-type Zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g25260.1 : HIT zinc finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033286
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G266600 calcium-dependent protein kinase CPK1 adapter protein 2, putative, expressed -
2 Sobic.002G364700 ZOS7-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.002G307400 MATH domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G071800 - -
5 Sobic.007G063800 - -
6 Sobic.009G061500 - -
7 Sobic.006G204500 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G299500 expressed protein -
9 Sobic.001G340800 exocyst complex component 6, putative, expressed -
10 Sobic.001G432200 pleckstrin homology domain-containing protein-related taxo, putative, expressed -
11 Sobic.004G250800 pre-mRNA-processing factor 31, putative, expressed K12844: U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP31
12 Sobic.004G290600 beige/BEACH domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G115700 WRKY35, expressed K18835: WRKY transcription factor 2
14 Sobic.005G221675 - -
15 Sobic.006G200300 oligopeptide transporter, putative, expressed -
16 Sobic.008G144701 - -
17 Sobic.004G052600 - -
18 Sobic.008G020800 GASR10 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
19 Sobic.006G070032 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
20 Sobic.004G100300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic008G007600--Sobic010G266600 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic008G007600--Sobic002G364700 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G007600--Sobic002G307400 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic008G007600--Sobic008G071800 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic008G007600--Sobic007G063800 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic008G007600--Sobic009G061500 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic008G007600--Sobic006G204500 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic008G007600--Sobic002G299500 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic008G007600--Sobic001G340800 Sobic010G266600--Sobic002G307400 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic010G266600--Sobic005G221675 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic010G266600--Sobic004G100300 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic010G266600--Sobic006G070032 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic010G266600--Sobic008G029800 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic010G266600--Sobic002G384900 Sobic006G200300 Sobic006G200300 Sobic010G266600--Sobic006G200300 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic010G266600--Sobic007G081800 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic010G266600--Sobic007G198900 Sobic002G364700--Sobic006G204500 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic002G364700--Sobic005G176700 Sobic001G370400 Sobic001G370400 Sobic002G364700--Sobic001G370400 Sobic006G115700 Sobic006G115700 Sobic002G364700--Sobic006G115700 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic002G364700--Sobic008G020800 Sobic002G364700--Sobic002G307400 Sobic002G364700--Sobic004G100300 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic002G364700--Sobic003G070400 Sobic002G364700--Sobic006G070032 Sobic002G307400--Sobic005G221675 Sobic002G307400--Sobic007G081800 Sobic002G307400--Sobic006G200300 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic002G307400--Sobic005G058300 Sobic002G307400--Sobic004G100300 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G307400--Sobic003G191200 Sobic002G307400--Sobic002G384900 Sobic002G307400--Sobic007G198900 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic002G307400--Sobic006G224400 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic008G071800--Sobic004G168200 Sobic008G071800--Sobic007G081800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic008G071800--Sobic004G046700 Sobic008G071800--Sobic005G058300 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic008G071800--Sobic010G123800 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic008G071800--Sobic007G082100 Sobic008G071800--Sobic002G307400 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic008G071800--Sobic001G211700 Sobic008G071800--Sobic002G384900 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic007G063800--Sobic010G038300 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic007G063800--Sobic005G202901 Sobic007G063800--Sobic010G266600 Sobic007G063800--Sobic006G204500 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic007G063800--Sobic004G014200 Sobic007G063800--Sobic006G070032 Sobic007G063800--Sobic002G364700 Sobic007G063800--Sobic008G007600 Sobic007G063800--Sobic008G029800 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic009G061500--Sobic009G061601 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic009G061500--Sobic008G136601 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic009G061500--Sobic003G297100 Sobic009G061500--Sobic001G340800 Sobic009G061500--Sobic008G020800 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic009G061500--Sobic005G114201 Sobic008G148600 Sobic008G148600 Sobic009G061500--Sobic008G148600 Sobic009G061500--Sobic001G370400 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic009G061500--Sobic007G095333 Sobic006G204500--Sobic009G061601 Sobic004G273600 Sobic004G273600 Sobic006G204500--Sobic004G273600 Sobic006G204500--Sobic008G020800 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic006G204500--Sobic001G402900 Sobic010G003200 Sobic010G003200 Sobic006G204500--Sobic010G003200 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic006G204500--Sobic002G372000 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic006G204500--Sobic007G197000 Sobic006G204500--Sobic002G364700 Sobic006G204500--Sobic004G014200 Sobic008G171900 Sobic008G171900 Sobic002G299500--Sobic008G171900 Sobic003G376900 Sobic003G376900 Sobic002G299500--Sobic003G376900 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic002G299500--Sobic009G163100 Sobic005G020600 Sobic005G020600 Sobic002G299500--Sobic005G020600 Sobic002G299500--Sobic008G007600 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic002G299500--Sobic003G352900 Sobic004G250800 Sobic004G250800 Sobic002G299500--Sobic004G250800 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic002G299500--Sobic009G202000 Sobic001G072000 Sobic001G072000 Sobic002G299500--Sobic001G072000 Sobic001G340800--Sobic001G370400 Sobic001G340800--Sobic009G061601 Sobic001G340800--Sobic008G136601 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic001G340800--Sobic004G290600 Sobic001G340800--Sobic009G061500 Sobic001G340800--Sobic008G020800 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic001G340800--Sobic001G294500 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic001G340800--Sobic007G131000 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic001G340800--Sobic003G093100
Octagon: transcription factors


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