Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G200300.1
Synonym ATOPT4, OPT4, Sb06g027230
Functional annotation oligopeptide transporter, putative, expressed
UniProt C5YF30
Pfam PF03169
Panther DB PTHR22601 PTHR22601:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G64410 : oligopeptide transporter 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g50820.1 : oligopeptide transporter, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032394 , Zm00025a056910 , Zm00025a032387 , Zm00025a032386 , Zm00025a032388
Brachypodium KQJ84335
Barley HORVU2Hr1G111690.1 , HORVU2Hr1G102890.1 , HORVU0Hr1G005640.1 , HORVU2Hr1G030450.1 , HORVU0Hr1G025700.5 , HORVU0Hr1G025700.1 , HORVU0Hr1G025700.2 , HORVU2Hr1G102890.2 , HORVU6Hr1G067430.12 , HORVU6Hr1G067430.13 , HORVU6Hr1G067430.14 , HORVU6Hr1G067430.16 , HORVU6Hr1G067430.2 , HORVU6Hr1G067430.3 , HORVU6Hr1G067430.6 , HORVU6Hr1G067430.7 , HORVU6Hr1G067430.21
Wheat TraesCS2D02G443600 , TraesCS2D02G443600 , TraesCS5D02G400800 , TraesCS6B02G293200 , TraesCS6B02G293100 , TraesCS6D02G248800 , TraesCS7D02G099500 , TraesCS5A02G391000 , TraesCS1A02G379600 , TraesCS1B02G401300 , TraesCS6D02G248700 , TraesCS2A02G444400 , TraesCS5B02G395800 , TraesCS2B02G465500 , TraesCS6A02G265800 , TraesCS6A02G265900 , TraesCS7A02G105300
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G307400 MATH domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G364300 - -
3 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -
4 Sobic.005G058200 expressed protein -
5 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
6 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
7 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
8 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.004G086900 - -
10 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
11 Sobic.008G095500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
12 Sobic.007G110800 expressed protein -
13 Sobic.008G177001 - -
14 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G058000 expressed protein -
16 Sobic.005G087732 - -
17 Sobic.007G167950 - -
18 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -
19 Sobic.005G058300 expressed protein -
20 Sobic.003G428500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G200300 Sobic006G200300 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic006G200300--Sobic002G307400 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic006G200300--Sobic001G364300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic006G200300--Sobic008G088500 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic006G200300--Sobic005G058200 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic006G200300--Sobic010G196700 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic006G200300--Sobic008G168500 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic006G200300--Sobic005G007200 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic006G200300--Sobic007G082300 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic006G200300--Sobic004G086900 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic002G307400--Sobic005G221675 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic002G307400--Sobic007G081800 Sobic002G307400--Sobic006G200300 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic002G307400--Sobic005G058300 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic002G307400--Sobic004G100300 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G307400--Sobic003G191200 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic002G307400--Sobic002G384900 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic002G307400--Sobic007G198900 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic002G307400--Sobic006G224400 Sobic001G364300--Sobic005G058200 Sobic001G364300--Sobic008G088500 Sobic001G364300--Sobic008G168500 Sobic001G364300--Sobic005G007200 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic001G364300--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic001G364300--Sobic005G058000 Sobic001G364300--Sobic007G082300 Sobic001G364300--Sobic004G086900 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic001G364300--Sobic008G177001 Sobic008G088500--Sobic008G168500 Sobic008G088500--Sobic001G364300 Sobic008G088500--Sobic002G096600 Sobic008G088500--Sobic005G058000 Sobic008G088500--Sobic005G058200 Sobic008G088500--Sobic005G007200 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G088500--Sobic001G021200 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G177001 Sobic005G058200--Sobic001G364300 Sobic005G058200--Sobic005G007200 Sobic005G058200--Sobic008G088500 Sobic005G058200--Sobic007G082300 Sobic005G058200--Sobic008G168500 Sobic005G058200--Sobic004G086900 Sobic005G058200--Sobic008G177001 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic005G058200--Sobic007G110800 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic005G058200--Sobic005G087732 Sobic010G196700--Sobic005G058200 Sobic010G196700--Sobic007G082300 Sobic010G196700--Sobic004G086900 Sobic010G196700--Sobic001G364300 Sobic010G196700--Sobic007G110800 Sobic010G196700--Sobic005G007200 Sobic010G196700--Sobic008G088500 Sobic010G196700--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic010G196700--Sobic007G167950 Sobic008G168500--Sobic008G088500 Sobic008G168500--Sobic002G096600 Sobic008G168500--Sobic005G058000 Sobic008G168500--Sobic001G364300 Sobic008G168500--Sobic005G058200 Sobic008G168500--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic001G021200 Sobic008G168500--Sobic008G095500 Sobic008G168500--Sobic008G177001 Sobic005G007200--Sobic005G058200 Sobic005G007200--Sobic001G364300 Sobic005G007200--Sobic008G088500 Sobic005G007200--Sobic008G168500 Sobic005G007200--Sobic007G082300 Sobic005G007200--Sobic004G086900 Sobic005G007200--Sobic002G096600 Sobic005G007200--Sobic005G058000 Sobic005G007200--Sobic008G177001 Sobic007G082300--Sobic004G086900 Sobic007G082300--Sobic005G087732 Sobic007G082300--Sobic007G167950 Sobic007G082300--Sobic007G110800 Sobic007G082300--Sobic005G058200 Sobic007G082300--Sobic006G224400 Sobic007G082300--Sobic005G058300 Sobic007G082300--Sobic005G007200 Sobic007G082300--Sobic007G081800 Sobic004G086900--Sobic007G082300 Sobic004G086900--Sobic005G087732 Sobic004G086900--Sobic007G167950 Sobic004G086900--Sobic007G110800 Sobic004G086900--Sobic006G224400 Sobic004G086900--Sobic005G058300 Sobic004G086900--Sobic005G058200 Sobic004G086900--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic004G086900--Sobic010G123800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.