Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G250800.1
Synonym Sb04g029035, emb1220
Functional annotation pre-mRNA-processing factor 31, putative, expressed
UniProt A0A194YRL1
Pfam PF09785 PF01798
Panther DB PTHR13904
NCBI CDD KOG2574; mRNA splicing factor PRP31
KEGG Orthology K12844; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP31
Gene Ontology GO:0000398; mRNA splicing, via spliceosome GO:0000244spliceosomal tri-snRNP complex assembly


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G60170 : pre-mRNA processing ribonucleoprotein binding region-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g04850.3 : pre-mRNA-processing factor 31, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G115700 WRKY35, expressed K18835: WRKY transcription factor 2
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20 Sobic.008G020800 GASR10 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G250800 Sobic004G250800 Sobic006G115700 Sobic006G115700 Sobic004G250800--Sobic006G115700 Sobic006G171600 Sobic006G171600 Sobic004G250800--Sobic006G171600 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic004G250800--Sobic008G007600 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic004G250800--Sobic002G364700 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic004G250800--Sobic002G299500 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic004G250800--Sobic009G061500 Sobic008G165401 Sobic008G165401 Sobic004G250800--Sobic008G165401 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic004G250800--Sobic002G307400 Sobic001G135800 Sobic001G135800 Sobic004G250800--Sobic001G135800 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic006G115700--Sobic003G297100 Sobic007G142801 Sobic007G142801 Sobic006G115700--Sobic007G142801 Sobic006G115700--Sobic001G135800 Sobic006G115700--Sobic002G364700 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic006G115700--Sobic009G061601 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic006G115700--Sobic001G432200 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic006G115700--Sobic005G176700 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic006G115700--Sobic006G204500 Sobic001G370400 Sobic001G370400 Sobic006G115700--Sobic001G370400 Sobic006G171600--Sobic006G115700 Sobic010G142650 Sobic010G142650 Sobic006G171600--Sobic010G142650 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic006G171600--Sobic009G242200 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic006G171600--Sobic004G290600 Sobic006G171600--Sobic006G204500 Sobic010G003200 Sobic010G003200 Sobic006G171600--Sobic010G003200 Sobic006G171600--Sobic003G297100 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic006G171600--Sobic002G340600 Sobic006G171600--Sobic002G364700 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic008G007600--Sobic010G266600 Sobic008G007600--Sobic002G364700 Sobic008G007600--Sobic002G307400 Sobic008G071800 Sobic008G071800 Sobic008G007600--Sobic008G071800 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic008G007600--Sobic007G063800 Sobic008G007600--Sobic009G061500 Sobic008G007600--Sobic006G204500 Sobic008G007600--Sobic002G299500 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic008G007600--Sobic001G340800 Sobic002G364700--Sobic006G204500 Sobic002G364700--Sobic005G176700 Sobic002G364700--Sobic001G370400 Sobic002G364700--Sobic006G115700 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic002G364700--Sobic008G020800 Sobic002G364700--Sobic002G307400 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic002G364700--Sobic004G100300 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic002G364700--Sobic003G070400 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic002G364700--Sobic006G070032 Sobic008G171900 Sobic008G171900 Sobic002G299500--Sobic008G171900 Sobic003G376900 Sobic003G376900 Sobic002G299500--Sobic003G376900 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic002G299500--Sobic009G163100 Sobic005G020600 Sobic005G020600 Sobic002G299500--Sobic005G020600 Sobic002G299500--Sobic008G007600 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic002G299500--Sobic003G352900 Sobic002G299500--Sobic004G250800 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic002G299500--Sobic009G202000 Sobic001G072000 Sobic001G072000 Sobic002G299500--Sobic001G072000 Sobic009G061500--Sobic009G061601 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic009G061500--Sobic008G136601 Sobic009G061500--Sobic003G297100 Sobic009G061500--Sobic001G340800 Sobic009G061500--Sobic008G020800 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic009G061500--Sobic005G114201 Sobic008G148600 Sobic008G148600 Sobic009G061500--Sobic008G148600 Sobic009G061500--Sobic001G370400 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic009G061500--Sobic007G095333 Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic008G165401--Sobic009G103650 Sobic001G099700 Sobic001G099700 Sobic008G165401--Sobic001G099700 Sobic008G165401--Sobic007G142801 Sobic008G165401--Sobic005G176700 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic008G165401--Sobic004G327000 Sobic004G095100 Sobic004G095100 Sobic008G165401--Sobic004G095100 Sobic008G165401--Sobic003G297100 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic008G165401--Sobic009G060000 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic008G165401--Sobic009G244100 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic002G307400--Sobic005G221675 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic002G307400--Sobic007G081800 Sobic006G200300 Sobic006G200300 Sobic002G307400--Sobic006G200300 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic002G307400--Sobic005G058300 Sobic002G307400--Sobic004G100300 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G307400--Sobic003G191200 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic002G307400--Sobic002G384900 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic002G307400--Sobic007G198900 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic002G307400--Sobic006G224400 Sobic001G135800--Sobic006G115700 Sobic001G135800--Sobic007G142801 Sobic001G135800--Sobic003G297100 Sobic001G172100 Sobic001G172100 Sobic001G135800--Sobic001G172100 Sobic005G026700 Sobic005G026700 Sobic001G135800--Sobic005G026700 Sobic003G164400 Sobic003G164400 Sobic001G135800--Sobic003G164400 Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic001G135800--Sobic002G000200 Sobic005G002100 Sobic005G002100 Sobic001G135800--Sobic005G002100 Sobic001G135800--Sobic009G061500
Octagon: transcription factors


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