Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G135800.1
Synonym
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5WPL1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g49670.2 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G115700 WRKY35, expressed K18835: WRKY transcription factor 2
2 Sobic.007G142801 - -
3 Sobic.003G297100 expressed protein -
4 Sobic.001G172100 - -
5 Sobic.005G026700 - -
6 Sobic.003G164400 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
7 Sobic.002G000200 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
8 Sobic.005G002100 protein kinase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G061500 - -
10 Sobic.010G142650 - -
11 Sobic.004G290600 beige/BEACH domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G214900 - -
13 Sobic.004G136100 - -
14 Sobic.006G001700 expressed protein -
15 Sobic.010G253600 OsFBL18 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.006G001650 - -
17 Sobic.005G114201 - -
18 Sobic.007G223400 ZOS2-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.003G102900 - -
20 Sobic.001G488950 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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