Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G136100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPH1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G237700 expressed protein -
2 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G089532 - -
4 Sobic.009G096700 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
5 Sobic.002G091200 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
7 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
9 Sobic.010G252600 cyclin-related protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
12 Sobic.010G093600 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
13 Sobic.003G438500 THION25 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
14 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G002200 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
16 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
17 Sobic.009G016700 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
18 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
19 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
20 Sobic.008G027800 pollen allergen, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G136100 Sobic004G136100 Sobic006G237700 Sobic006G237700 Sobic004G136100--Sobic006G237700 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G136100--Sobic002G283000 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic004G136100--Sobic009G089532 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic004G136100--Sobic009G096700 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic004G136100--Sobic002G091200 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic004G136100--Sobic009G098900 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic004G136100--Sobic001G539700 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic004G136100--Sobic008G028100 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic004G136100--Sobic010G252600 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic006G237700--Sobic003G164700 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic006G237700--Sobic001G228000 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic006G237700--Sobic002G197900 Sobic001G240900 Sobic001G240900 Sobic006G237700--Sobic001G240900 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic006G237700--Sobic008G119501 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic006G237700--Sobic001G002200 Sobic002G150400 Sobic002G150400 Sobic006G237700--Sobic002G150400 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic006G237700--Sobic001G348600 Sobic010G229801 Sobic010G229801 Sobic006G237700--Sobic010G229801 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic002G283000--Sobic004G137200 Sobic002G283000--Sobic009G089532 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic002G283000--Sobic004G025500 Sobic002G283000--Sobic009G098900 Sobic002G283000--Sobic001G539700 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic002G283000--Sobic004G251900 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G283000--Sobic003G173800 Sobic002G283000--Sobic008G028100 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G283000--Sobic005G010000 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic009G096700--Sobic010G093600 Sobic009G096700--Sobic008G028100 Sobic009G096700--Sobic009G089532 Sobic009G096700--Sobic001G539700 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic009G096700--Sobic008G027800 Sobic009G096700--Sobic009G016700 Sobic009G096700--Sobic002G002600 Sobic009G096700--Sobic001G002200 Sobic009G096700--Sobic008G028300 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G091200--Sobic001G540000 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic004G025600 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic003G173800 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic002G091200--Sobic004G350400 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic004G137200 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic001G539700 Sobic008G028100--Sobic009G089532 Sobic008G028100--Sobic002G002600 Sobic008G028100--Sobic009G016700 Sobic008G028100--Sobic010G093600 Sobic008G028100--Sobic009G096700 Sobic008G028100--Sobic008G028300 Sobic008G028100--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic009G098900 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic010G252600--Sobic004G166100 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic010G252600--Sobic001G528700 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic010G252600--Sobic007G222500 Sobic010G252600--Sobic007G222400 Sobic010G252600--Sobic001G348600 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic010G252600--Sobic004G024000 Sobic010G252600--Sobic009G016700 Sobic010G252600--Sobic008G028300 Sobic010G252600--Sobic001G002200
Octagon: transcription factors


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