Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G078200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q9T5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20230.1 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G170400 OsFBDUF58 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G337100 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
3 Sobic.002G015900 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G019450 - -
5 Sobic.001G402900 methyltransferase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G114201 - -
7 Sobic.010G188500 OsSub50 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
8 Sobic.002G340600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative, expressed K17871: NADH:ubiquinone reductase (non-electrogenic)
9 Sobic.008G020800 GASR10 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
10 Sobic.009G250300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G106600 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G014200 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
13 Sobic.007G095333 - -
14 Sobic.006G042600 - -
15 Sobic.008G086500 - -
16 Sobic.001G357400 emp24/gp25L/p24 family protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G074150 - -
18 Sobic.002G380300 ras-related protein, putative, expressed K07893: Ras-related protein Rab-6A
19 Sobic.007G016700 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G216100 leaf senescence related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G078200 Sobic002G078200 Sobic005G170400 Sobic005G170400 Sobic002G078200--Sobic005G170400 Sobic001G337100 Sobic001G337100 Sobic002G078200--Sobic001G337100 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic002G078200--Sobic002G015900 Sobic003G019450 Sobic003G019450 Sobic002G078200--Sobic003G019450 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic002G078200--Sobic001G402900 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic002G078200--Sobic005G114201 Sobic010G188500 Sobic010G188500 Sobic002G078200--Sobic010G188500 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic002G078200--Sobic002G340600 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic002G078200--Sobic008G020800 Sobic010G111000 Sobic010G111000 Sobic005G170400--Sobic010G111000 Sobic001G041600 Sobic001G041600 Sobic005G170400--Sobic001G041600 Sobic008G176500 Sobic008G176500 Sobic005G170400--Sobic008G176500 Sobic010G098932 Sobic010G098932 Sobic005G170400--Sobic010G098932 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic005G170400--Sobic005G207700 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic005G170400--Sobic002G380300 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic005G170400--Sobic006G043101 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic005G170400--Sobic008G125801 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic005G170400--Sobic005G214800 Sobic001G337100--Sobic002G015900 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic001G337100--Sobic008G086500 Sobic009G250300 Sobic009G250300 Sobic001G337100--Sobic009G250300 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic001G337100--Sobic002G194201 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic001G337100--Sobic005G006400 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic001G337100--Sobic003G007650 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic001G337100--Sobic007G035200 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic001G337100--Sobic007G134501 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic001G337100--Sobic010G216100 Sobic002G015900--Sobic009G250300 Sobic002G015900--Sobic001G337100 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic002G015900--Sobic001G063300 Sobic002G015900--Sobic008G086500 Sobic002G015900--Sobic005G006400 Sobic002G015900--Sobic002G194201 Sobic002G015900--Sobic003G007650 Sobic002G015900--Sobic007G035200 Sobic002G015900--Sobic007G134501 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic003G019450--Sobic006G020400 Sobic003G019450--Sobic008G176500 Sobic003G019450--Sobic008G125801 Sobic006G074150 Sobic006G074150 Sobic003G019450--Sobic006G074150 Sobic003G019450--Sobic001G041600 Sobic003G019450--Sobic002G015900 Sobic003G019450--Sobic001G337100 Sobic004G094400 Sobic004G094400 Sobic003G019450--Sobic004G094400 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic003G019450--Sobic010G215000 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic001G402900--Sobic006G205400 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic001G402900--Sobic001G093100 Sobic009G175400 Sobic009G175400 Sobic001G402900--Sobic009G175400 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic001G402900--Sobic002G254700 Sobic005G040700 Sobic005G040700 Sobic001G402900--Sobic005G040700 Sobic010G051000 Sobic010G051000 Sobic001G402900--Sobic010G051000 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic001G402900--Sobic010G144700 Sobic001G332000 Sobic001G332000 Sobic001G402900--Sobic001G332000 Sobic001G130500 Sobic001G130500 Sobic001G402900--Sobic001G130500 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic005G114201--Sobic007G095333 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic005G114201--Sobic005G220400 Sobic005G114201--Sobic010G215000 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic005G114201--Sobic007G129800 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic005G114201--Sobic002G414000 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic005G114201--Sobic002G194300 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic005G114201--Sobic003G445300 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic005G114201--Sobic002G082400 Sobic005G114201--Sobic006G043101 Sobic006G042600 Sobic006G042600 Sobic010G188500--Sobic006G042600 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic010G188500--Sobic007G122600 Sobic010G188500--Sobic008G086500 Sobic010G188500--Sobic002G194201 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic010G188500--Sobic005G006100 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic010G188500--Sobic010G240300 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic010G188500--Sobic010G207800 Sobic010G188500--Sobic010G216100 Sobic007G014000 Sobic007G014000 Sobic010G188500--Sobic007G014000 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic002G340600--Sobic006G105100 Sobic002G340600--Sobic002G380300 Sobic002G340600--Sobic001G041600 Sobic006G005300 Sobic006G005300 Sobic002G340600--Sobic006G005300 Sobic002G340600--Sobic003G445300 Sobic002G340600--Sobic006G074150 Sobic002G340600--Sobic005G220400 Sobic002G340600--Sobic005G207700 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic002G340600--Sobic003G304600 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic008G020800--Sobic005G176700 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic008G020800--Sobic001G167300 Sobic008G020800--Sobic005G006100 Sobic008G020800--Sobic007G122600 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic008G020800--Sobic006G070032 Sobic007G215200 Sobic007G215200 Sobic008G020800--Sobic007G215200 Sobic008G020800--Sobic002G194201 Sobic008G020800--Sobic010G207800 Sobic008G020800--Sobic002G015900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.