Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G014200.1
Synonym Sb04g001380
Functional annotation serpin domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKG2
Pfam PF00079
Panther DB PTHR11461 PTHR11461:SF169
NCBI CDD KOG2392; Serpin
KEGG Orthology K13963; serpin B
Gene Ontology GO:0005615; extracellular space


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G45220 : Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43590.1 : serpin domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G043530.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G016700 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
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5 Sobic.010G098932 - -
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8 Sobic.002G194300 expressed protein -
9 Sobic.003G351100 - -
10 Sobic.008G086500 - -
11 Sobic.005G006400 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.007G035200 - -
13 Sobic.001G240700 - -
14 Sobic.010G240300 Os12bglu38 - beta-glucosidase/beta-mannosidase/exoglucanase homologue, expressed K05350: beta-glucosidase
15 Sobic.007G160501 - -
16 Sobic.010G215000 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G007650 - -
18 Sobic.007G133800 - -
19 Sobic.010G216100 leaf senescence related protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G090200 OsMADS63 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic007G016700 Sobic007G016700 Sobic004G014200--Sobic007G016700 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic004G014200--Sobic008G020800 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic004G014200--Sobic001G402900 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic004G014200--Sobic006G070032 Sobic010G098932 Sobic010G098932 Sobic004G014200--Sobic010G098932 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic004G014200--Sobic002G015900 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic004G014200--Sobic001G063300 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic004G014200--Sobic002G194300 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic004G014200--Sobic003G351100 Sobic007G016700--Sobic004G014200 Sobic007G016700--Sobic010G098932 Sobic007G016700--Sobic003G351100 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic007G016700--Sobic007G160501 Sobic007G016700--Sobic002G194300 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic007G016700--Sobic005G043300 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic007G016700--Sobic010G215000 Sobic007G133800 Sobic007G133800 Sobic007G016700--Sobic007G133800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic007G016700--Sobic001G246001 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic008G020800--Sobic005G176700 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic008G020800--Sobic001G167300 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic008G020800--Sobic005G006100 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic008G020800--Sobic007G122600 Sobic008G020800--Sobic006G070032 Sobic007G215200 Sobic007G215200 Sobic008G020800--Sobic007G215200 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic008G020800--Sobic002G194201 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic008G020800--Sobic010G207800 Sobic008G020800--Sobic002G015900 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic001G402900--Sobic006G205400 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic001G402900--Sobic001G093100 Sobic009G175400 Sobic009G175400 Sobic001G402900--Sobic009G175400 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic001G402900--Sobic002G254700 Sobic005G040700 Sobic005G040700 Sobic001G402900--Sobic005G040700 Sobic010G051000 Sobic010G051000 Sobic001G402900--Sobic010G051000 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic001G402900--Sobic010G144700 Sobic001G332000 Sobic001G332000 Sobic001G402900--Sobic001G332000 Sobic001G130500 Sobic001G130500 Sobic001G402900--Sobic001G130500 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic006G070032--Sobic002G156400 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic006G070032--Sobic008G138400 Sobic006G070032--Sobic008G020800 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic006G070032--Sobic002G097300 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic006G070032--Sobic005G189100 Sobic001G240700 Sobic001G240700 Sobic006G070032--Sobic001G240700 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic006G070032--Sobic005G140900 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic006G070032--Sobic001G089300 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic006G070032--Sobic002G006200 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic010G098932--Sobic001G269200 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic010G098932--Sobic010G107800 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic010G098932--Sobic002G414000 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic010G098932--Sobic006G043101 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic010G098932--Sobic005G220500 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic010G098932--Sobic007G129800 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic010G098932--Sobic005G214800 Sobic010G098932--Sobic001G246001 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic010G098932--Sobic007G167000 Sobic009G250300 Sobic009G250300 Sobic002G015900--Sobic009G250300 Sobic001G337100 Sobic001G337100 Sobic002G015900--Sobic001G337100 Sobic002G015900--Sobic001G063300 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic002G015900--Sobic008G086500 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic002G015900--Sobic005G006400 Sobic002G015900--Sobic002G194201 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic002G015900--Sobic003G007650 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic002G015900--Sobic007G035200 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic002G015900--Sobic007G134501 Sobic001G261416 Sobic001G261416 Sobic001G063300--Sobic001G261416 Sobic010G090200 Sobic010G090200 Sobic001G063300--Sobic010G090200 Sobic001G063300--Sobic010G207800 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic001G063300--Sobic010G216100 Sobic007G014000 Sobic007G014000 Sobic001G063300--Sobic007G014000 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic001G063300--Sobic010G240300 Sobic001G063300--Sobic007G215200 Sobic001G287400 Sobic001G287400 Sobic001G063300--Sobic001G287400 Sobic001G063300--Sobic005G006100 Sobic002G194300--Sobic003G351100 Sobic002G194300--Sobic010G215000 Sobic002G194300--Sobic007G160501 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic002G194300--Sobic007G095333 Sobic002G194300--Sobic008G086500 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic002G194300--Sobic008G125801 Sobic002G194300--Sobic010G216100 Sobic002G194300--Sobic010G240300 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic002G194300--Sobic009G110800 Sobic003G351100--Sobic007G160501 Sobic003G351100--Sobic002G194300 Sobic003G351100--Sobic010G215000 Sobic003G351100--Sobic008G125801 Sobic003G351100--Sobic001G246001 Sobic003G351100--Sobic005G214800 Sobic003G351100--Sobic009G110800 Sobic003G351100--Sobic010G090200 Sobic003G351100--Sobic005G006400
Octagon: transcription factors


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