Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G016700.1
Synonym Sb07g001455
Functional annotation OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PFE2
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF111
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g40370.1 : OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ92239 , KQJ92237
Barley -
Wheat TraesCS6A02G046000 , TraesCS6B02G062100 , TraesCS6D02G053200 , TraesCS6A02G048500 , TraesCSU02G107500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G014200 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
2 Sobic.010G098932 - -
3 Sobic.003G351100 - -
4 Sobic.007G160501 - -
5 Sobic.002G194300 expressed protein -
6 Sobic.005G043300 - -
7 Sobic.010G215000 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
8 Sobic.007G133800 - -
9 Sobic.001G246001 - K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.005G214800 - -
11 Sobic.008G125801 - -
12 Sobic.009G110800 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G165700 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G445300 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
15 Sobic.007G035200 - -
16 Sobic.005G006400 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.002G414000 - -
18 Sobic.010G090200 OsMADS63 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -
19 Sobic.005G220400 pollen allergen, putative, expressed -
20 Sobic.008G086500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G016700 Sobic007G016700 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic007G016700--Sobic004G014200 Sobic010G098932 Sobic010G098932 Sobic007G016700--Sobic010G098932 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic007G016700--Sobic003G351100 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic007G016700--Sobic007G160501 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic007G016700--Sobic002G194300 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic007G016700--Sobic005G043300 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic007G016700--Sobic010G215000 Sobic007G133800 Sobic007G133800 Sobic007G016700--Sobic007G133800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic007G016700--Sobic001G246001 Sobic004G014200--Sobic007G016700 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic004G014200--Sobic008G020800 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic004G014200--Sobic001G402900 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic004G014200--Sobic006G070032 Sobic004G014200--Sobic010G098932 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic004G014200--Sobic002G015900 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic004G014200--Sobic001G063300 Sobic004G014200--Sobic002G194300 Sobic004G014200--Sobic003G351100 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic010G098932--Sobic001G269200 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic010G098932--Sobic010G107800 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic010G098932--Sobic002G414000 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic010G098932--Sobic006G043101 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic010G098932--Sobic005G220500 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic010G098932--Sobic007G129800 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic010G098932--Sobic005G214800 Sobic010G098932--Sobic001G246001 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic010G098932--Sobic007G167000 Sobic003G351100--Sobic007G160501 Sobic003G351100--Sobic002G194300 Sobic003G351100--Sobic010G215000 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic003G351100--Sobic008G125801 Sobic003G351100--Sobic001G246001 Sobic003G351100--Sobic005G214800 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic003G351100--Sobic009G110800 Sobic010G090200 Sobic010G090200 Sobic003G351100--Sobic010G090200 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic003G351100--Sobic005G006400 Sobic007G160501--Sobic003G351100 Sobic007G160501--Sobic001G246001 Sobic007G160501--Sobic005G214800 Sobic007G160501--Sobic009G110800 Sobic007G160501--Sobic010G215000 Sobic007G160501--Sobic008G125801 Sobic007G160501--Sobic002G194300 Sobic007G160501--Sobic002G414000 Sobic007G160501--Sobic006G043101 Sobic002G194300--Sobic003G351100 Sobic002G194300--Sobic010G215000 Sobic002G194300--Sobic007G160501 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic002G194300--Sobic007G095333 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic002G194300--Sobic008G086500 Sobic002G194300--Sobic008G125801 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic002G194300--Sobic010G216100 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic002G194300--Sobic010G240300 Sobic002G194300--Sobic009G110800 Sobic005G043300--Sobic007G160501 Sobic005G043300--Sobic001G246001 Sobic005G043300--Sobic005G214800 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic005G043300--Sobic003G445300 Sobic005G043300--Sobic002G414000 Sobic005G043300--Sobic003G351100 Sobic005G043300--Sobic009G110800 Sobic005G043300--Sobic010G215000 Sobic005G043300--Sobic008G125801 Sobic010G215000--Sobic002G194300 Sobic001G165700 Sobic001G165700 Sobic010G215000--Sobic001G165700 Sobic010G215000--Sobic007G160501 Sobic010G215000--Sobic003G351100 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic010G215000--Sobic005G220400 Sobic001G171300 Sobic001G171300 Sobic010G215000--Sobic001G171300 Sobic010G215000--Sobic003G445300 Sobic010G215000--Sobic007G095333 Sobic001G261416 Sobic001G261416 Sobic010G215000--Sobic001G261416 Sobic007G133800--Sobic008G086500 Sobic007G133800--Sobic002G194300 Sobic007G133800--Sobic010G240300 Sobic007G133800--Sobic005G006400 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic007G133800--Sobic007G035200 Sobic007G133800--Sobic003G351100 Sobic007G014000 Sobic007G014000 Sobic007G133800--Sobic007G014000 Sobic007G133800--Sobic010G215000 Sobic007G133800--Sobic010G216100 Sobic001G246001--Sobic001G246001 Sobic001G246001--Sobic002G414000 Sobic001G246001--Sobic007G160501 Sobic001G246001--Sobic006G043101 Sobic001G246001--Sobic009G110800 Sobic001G246001--Sobic003G445300 Sobic001G246001--Sobic005G220400 Sobic001G246001--Sobic005G220500 Sobic001G246001--Sobic001G269200
Octagon: transcription factors


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