Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G110800.1
Synonym Sb09g017912
Functional annotation OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6P812
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF139
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26340 : F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42230.1 : OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G171300 UDP-glucose 6-dehydrogenase, putative, expressed K00012: UGDH, UDPglucose 6-dehydrogenase


Gene co-expression network
sample Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic009G110800--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic009G110800--Sobic005G214800 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic009G110800--Sobic007G160501 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic009G110800--Sobic002G414000 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic009G110800--Sobic006G043101 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic009G110800--Sobic003G351100 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic009G110800--Sobic003G445300 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic009G110800--Sobic005G220400 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic009G110800--Sobic008G125801 Sobic001G246001--Sobic001G246001 Sobic001G246001--Sobic002G414000 Sobic001G246001--Sobic007G160501 Sobic001G246001--Sobic006G043101 Sobic001G246001--Sobic009G110800 Sobic001G246001--Sobic003G445300 Sobic001G246001--Sobic005G220400 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic001G246001--Sobic005G220500 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic001G246001--Sobic001G269200 Sobic005G214800--Sobic001G246001 Sobic005G214800--Sobic002G414000 Sobic005G214800--Sobic007G160501 Sobic005G214800--Sobic006G043101 Sobic005G214800--Sobic009G110800 Sobic005G214800--Sobic003G445300 Sobic005G214800--Sobic005G220400 Sobic005G214800--Sobic005G220500 Sobic005G214800--Sobic001G269200 Sobic007G160501--Sobic003G351100 Sobic007G160501--Sobic001G246001 Sobic007G160501--Sobic005G214800 Sobic007G160501--Sobic009G110800 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic007G160501--Sobic010G215000 Sobic007G160501--Sobic008G125801 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic007G160501--Sobic002G194300 Sobic007G160501--Sobic002G414000 Sobic007G160501--Sobic006G043101 Sobic002G414000--Sobic006G043101 Sobic002G414000--Sobic005G214800 Sobic002G414000--Sobic001G246001 Sobic002G414000--Sobic005G220400 Sobic002G414000--Sobic001G269200 Sobic002G414000--Sobic003G445300 Sobic002G414000--Sobic005G220500 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic002G414000--Sobic010G107800 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic002G414000--Sobic002G082400 Sobic006G043101--Sobic002G414000 Sobic006G043101--Sobic005G214800 Sobic006G043101--Sobic001G246001 Sobic006G043101--Sobic001G269200 Sobic006G043101--Sobic005G220400 Sobic006G043101--Sobic003G445300 Sobic006G043101--Sobic005G220500 Sobic006G043101--Sobic010G107800 Sobic006G043101--Sobic002G082400 Sobic003G351100--Sobic007G160501 Sobic003G351100--Sobic002G194300 Sobic003G351100--Sobic010G215000 Sobic003G351100--Sobic008G125801 Sobic003G351100--Sobic001G246001 Sobic003G351100--Sobic005G214800 Sobic003G351100--Sobic009G110800 Sobic010G090200 Sobic010G090200 Sobic003G351100--Sobic010G090200 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic003G351100--Sobic005G006400 Sobic003G445300--Sobic005G220400 Sobic003G445300--Sobic002G082400 Sobic003G445300--Sobic005G220500 Sobic003G445300--Sobic002G414000 Sobic003G445300--Sobic001G269200 Sobic003G445300--Sobic006G043101 Sobic003G445300--Sobic005G214800 Sobic003G445300--Sobic001G246001 Sobic001G165700 Sobic001G165700 Sobic003G445300--Sobic001G165700 Sobic005G220400--Sobic003G445300 Sobic005G220400--Sobic002G082400 Sobic005G220400--Sobic002G414000 Sobic005G220400--Sobic005G220500 Sobic005G220400--Sobic006G043101 Sobic005G220400--Sobic001G269200 Sobic005G220400--Sobic005G214800 Sobic005G220400--Sobic001G246001 Sobic005G220400--Sobic010G215000 Sobic008G125801--Sobic007G160501 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic008G125801--Sobic006G020400 Sobic008G125801--Sobic003G351100 Sobic008G125801--Sobic001G246001 Sobic008G125801--Sobic005G214800 Sobic008G125801--Sobic009G110800 Sobic008G125801--Sobic010G215000 Sobic008G125801--Sobic002G194300 Sobic008G125801--Sobic002G414000
Octagon: transcription factors


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