Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G019450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVF6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G020400 expressed protein -
2 Sobic.008G176500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@AGC_AGC_other_GWLd.1 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
3 Sobic.008G125801 - -
4 Sobic.006G074150 - -
5 Sobic.001G041600 clathrin adaptor complex small chain domain containing protein, expressed K12394: AP-1 complex subunit sigma 1/2
6 Sobic.002G015900 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G337100 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
8 Sobic.004G094400 - -
9 Sobic.010G215000 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G194300 expressed protein -
11 Sobic.009G250300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G095333 - -
13 Sobic.007G160501 - -
14 Sobic.010G216100 leaf senescence related protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G351100 - -
16 Sobic.005G220400 pollen allergen, putative, expressed -
17 Sobic.003G445300 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
18 Sobic.001G246001 - K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.005G214800 - -
20 Sobic.006G043101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G019450 Sobic003G019450 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic003G019450--Sobic006G020400 Sobic008G176500 Sobic008G176500 Sobic003G019450--Sobic008G176500 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic003G019450--Sobic008G125801 Sobic006G074150 Sobic006G074150 Sobic003G019450--Sobic006G074150 Sobic001G041600 Sobic001G041600 Sobic003G019450--Sobic001G041600 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic003G019450--Sobic002G015900 Sobic001G337100 Sobic001G337100 Sobic003G019450--Sobic001G337100 Sobic004G094400 Sobic004G094400 Sobic003G019450--Sobic004G094400 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic003G019450--Sobic010G215000 Sobic006G020400--Sobic008G125801 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic006G020400--Sobic003G351100 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic006G020400--Sobic007G160501 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic006G020400--Sobic002G194300 Sobic006G020400--Sobic010G215000 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic006G020400--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic006G020400--Sobic005G214800 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic006G020400--Sobic009G110800 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic006G020400--Sobic002G414000 Sobic008G176500--Sobic001G041600 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic008G176500--Sobic003G304600 Sobic009G203900 Sobic009G203900 Sobic008G176500--Sobic009G203900 Sobic007G222100 Sobic007G222100 Sobic008G176500--Sobic007G222100 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic008G176500--Sobic002G053800 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic008G176500--Sobic004G293300 Sobic001G130500 Sobic001G130500 Sobic008G176500--Sobic001G130500 Sobic010G051000 Sobic010G051000 Sobic008G176500--Sobic010G051000 Sobic001G024900 Sobic001G024900 Sobic008G176500--Sobic001G024900 Sobic008G125801--Sobic007G160501 Sobic008G125801--Sobic006G020400 Sobic008G125801--Sobic003G351100 Sobic008G125801--Sobic001G246001 Sobic008G125801--Sobic005G214800 Sobic008G125801--Sobic009G110800 Sobic008G125801--Sobic010G215000 Sobic008G125801--Sobic002G194300 Sobic008G125801--Sobic002G414000 Sobic009G207700 Sobic009G207700 Sobic006G074150--Sobic009G207700 Sobic001G093100 Sobic001G093100 Sobic006G074150--Sobic001G093100 Sobic005G040700 Sobic005G040700 Sobic006G074150--Sobic005G040700 Sobic006G074150--Sobic001G130500 Sobic006G074150--Sobic010G051000 Sobic001G306500 Sobic001G306500 Sobic006G074150--Sobic001G306500 Sobic003G175950 Sobic003G175950 Sobic006G074150--Sobic003G175950 Sobic006G074150--Sobic007G222100 Sobic006G074150--Sobic009G203900 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic001G041600--Sobic002G082400 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic001G041600--Sobic005G220500 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic001G041600--Sobic003G445300 Sobic003G175600 Sobic003G175600 Sobic001G041600--Sobic003G175600 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic001G041600--Sobic005G220400 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic001G041600--Sobic001G269200 Sobic001G041600--Sobic009G203900 Sobic001G041600--Sobic004G293300 Sobic001G041600--Sobic002G053800 Sobic009G250300 Sobic009G250300 Sobic002G015900--Sobic009G250300 Sobic002G015900--Sobic001G337100 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic002G015900--Sobic001G063300 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic002G015900--Sobic008G086500 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic002G015900--Sobic005G006400 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic002G015900--Sobic002G194201 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic002G015900--Sobic003G007650 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic002G015900--Sobic007G035200 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic002G015900--Sobic007G134501 Sobic001G337100--Sobic002G015900 Sobic001G337100--Sobic008G086500 Sobic001G337100--Sobic009G250300 Sobic001G337100--Sobic002G194201 Sobic001G337100--Sobic005G006400 Sobic001G337100--Sobic003G007650 Sobic001G337100--Sobic007G035200 Sobic001G337100--Sobic007G134501 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic001G337100--Sobic010G216100 Sobic004G094400--Sobic007G035200 Sobic004G094400--Sobic005G006400 Sobic004G094400--Sobic003G007650 Sobic004G094400--Sobic006G020400 Sobic004G094400--Sobic007G134501 Sobic004G094400--Sobic008G086500 Sobic004G094400--Sobic002G194201 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic004G094400--Sobic010G240300 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic004G094400--Sobic005G006100 Sobic010G215000--Sobic002G194300 Sobic001G165700 Sobic001G165700 Sobic010G215000--Sobic001G165700 Sobic010G215000--Sobic007G160501 Sobic010G215000--Sobic003G351100 Sobic010G215000--Sobic005G220400 Sobic001G171300 Sobic001G171300 Sobic010G215000--Sobic001G171300 Sobic010G215000--Sobic003G445300 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic010G215000--Sobic007G095333 Sobic001G261416 Sobic001G261416 Sobic010G215000--Sobic001G261416
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.