Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G094400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YNM2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G035200 - -
2 Sobic.005G006400 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.003G007650 - -
4 Sobic.006G020400 expressed protein -
5 Sobic.007G134501 - -
6 Sobic.008G086500 - -
7 Sobic.002G194201 - -
8 Sobic.010G240300 Os12bglu38 - beta-glucosidase/beta-mannosidase/exoglucanase homologue, expressed K05350: beta-glucosidase
9 Sobic.005G006100 hypothetical protein -
10 Sobic.003G351100 - -
11 Sobic.008G125801 - -
12 Sobic.010G216100 leaf senescence related protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G194300 expressed protein -
14 Sobic.007G014000 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G090200 OsMADS63 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -
16 Sobic.005G040100 expressed protein -
17 Sobic.007G122600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G160501 - -
19 Sobic.003G245300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G215000 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G094400 Sobic004G094400 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic004G094400--Sobic007G035200 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic004G094400--Sobic005G006400 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic004G094400--Sobic003G007650 Sobic006G020400 Sobic006G020400 Sobic004G094400--Sobic006G020400 Sobic007G134501 Sobic007G134501 Sobic004G094400--Sobic007G134501 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic004G094400--Sobic008G086500 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic004G094400--Sobic002G194201 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic004G094400--Sobic010G240300 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic004G094400--Sobic005G006100 Sobic007G035200--Sobic005G006400 Sobic007G035200--Sobic003G007650 Sobic007G035200--Sobic008G086500 Sobic007G035200--Sobic010G240300 Sobic007G035200--Sobic007G134501 Sobic007G035200--Sobic002G194201 Sobic007G035200--Sobic005G006100 Sobic007G014000 Sobic007G014000 Sobic007G035200--Sobic007G014000 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic007G035200--Sobic010G216100 Sobic005G006400--Sobic007G035200 Sobic005G006400--Sobic003G007650 Sobic005G006400--Sobic010G240300 Sobic005G006400--Sobic008G086500 Sobic005G006400--Sobic002G194201 Sobic005G006400--Sobic007G134501 Sobic005G006400--Sobic005G006100 Sobic005G006400--Sobic007G014000 Sobic005G006400--Sobic010G216100 Sobic003G007650--Sobic007G035200 Sobic003G007650--Sobic007G134501 Sobic003G007650--Sobic005G006400 Sobic003G007650--Sobic002G194201 Sobic003G007650--Sobic008G086500 Sobic003G007650--Sobic010G240300 Sobic003G007650--Sobic005G006100 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic003G007650--Sobic005G040100 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic003G007650--Sobic007G122600 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic006G020400--Sobic008G125801 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic006G020400--Sobic003G351100 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic006G020400--Sobic007G160501 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic006G020400--Sobic002G194300 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic006G020400--Sobic010G215000 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic006G020400--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic006G020400--Sobic005G214800 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic006G020400--Sobic009G110800 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic006G020400--Sobic002G414000 Sobic007G134501--Sobic003G007650 Sobic007G134501--Sobic002G194201 Sobic007G134501--Sobic005G040100 Sobic007G134501--Sobic007G035200 Sobic007G134501--Sobic005G006400 Sobic007G134501--Sobic007G122600 Sobic007G134501--Sobic005G006100 Sobic007G134501--Sobic008G086500 Sobic007G134501--Sobic010G240300 Sobic008G086500--Sobic005G006400 Sobic008G086500--Sobic010G240300 Sobic008G086500--Sobic007G035200 Sobic008G086500--Sobic003G007650 Sobic008G086500--Sobic002G194201 Sobic008G086500--Sobic010G216100 Sobic008G086500--Sobic007G014000 Sobic008G086500--Sobic002G194300 Sobic008G086500--Sobic007G134501 Sobic002G194201--Sobic007G134501 Sobic002G194201--Sobic003G007650 Sobic002G194201--Sobic005G006400 Sobic002G194201--Sobic007G035200 Sobic002G194201--Sobic007G122600 Sobic002G194201--Sobic005G040100 Sobic002G194201--Sobic008G086500 Sobic002G194201--Sobic005G006100 Sobic002G194201--Sobic010G240300 Sobic010G240300--Sobic005G006400 Sobic010G240300--Sobic007G014000 Sobic010G240300--Sobic008G086500 Sobic010G240300--Sobic010G216100 Sobic010G240300--Sobic007G035200 Sobic010G090200 Sobic010G090200 Sobic010G240300--Sobic010G090200 Sobic010G240300--Sobic003G007650 Sobic010G240300--Sobic005G006100 Sobic010G240300--Sobic002G194201 Sobic005G006100--Sobic007G122600 Sobic005G006100--Sobic007G134501 Sobic005G006100--Sobic002G194201 Sobic005G006100--Sobic003G007650 Sobic005G006100--Sobic010G240300 Sobic005G006100--Sobic005G006400 Sobic005G006100--Sobic007G035200 Sobic005G006100--Sobic005G040100 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic005G006100--Sobic010G207800
Octagon: transcription factors


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