Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G171700.1
Synonym
Functional annotation OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PT22
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33110 PTHR33110:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g25140.1 : OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G155400 ankyrin, putative, expressed -
2 Sobic.004G140400 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
3 Sobic.004G178700 protein transport protein Sec61, putative, expressed K10956: protein transport protein SEC61 subunit alpha
4 Sobic.001G270700 nodulin, putative, expressed -
5 Sobic.001G490950 - -
6 Sobic.002G102300 - -
7 Sobic.003G392275 - -
8 Sobic.001G226900 zinc finger family protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G056800 expressed protein -
10 Sobic.008G057600 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G239700 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G006800 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
13 Sobic.003G048400 - -
14 Sobic.004G051600 EMB2758, putative, expressed -
15 Sobic.002G304801 - -
16 Sobic.008G036600 expressed protein -
17 Sobic.010G064200 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
18 Sobic.003G141600 - -
19 Sobic.010G134650 - -
20 Sobic.003G238250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G171700 Sobic005G171700 Sobic008G155400 Sobic008G155400 Sobic005G171700--Sobic008G155400 Sobic004G140400 Sobic004G140400 Sobic005G171700--Sobic004G140400 Sobic004G178700 Sobic004G178700 Sobic005G171700--Sobic004G178700 Sobic001G270700 Sobic001G270700 Sobic005G171700--Sobic001G270700 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic005G171700--Sobic001G490950 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic005G171700--Sobic002G102300 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic005G171700--Sobic003G392275 Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic005G171700--Sobic001G226900 Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic005G171700--Sobic008G056800 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic008G155400--Sobic002G158300 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic008G155400--Sobic003G342500 Sobic008G155400--Sobic005G171700 Sobic008G155400--Sobic004G140400 Sobic008G155400--Sobic002G102300 Sobic008G036600 Sobic008G036600 Sobic008G155400--Sobic008G036600 Sobic008G155400--Sobic001G270700 Sobic003G213000 Sobic003G213000 Sobic008G155400--Sobic003G213000 Sobic002G108100 Sobic002G108100 Sobic008G155400--Sobic002G108100 Sobic004G140400--Sobic002G102300 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic004G140400--Sobic005G225500 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic004G140400--Sobic007G101600 Sobic008G159701 Sobic008G159701 Sobic004G140400--Sobic008G159701 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic004G140400--Sobic002G304801 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic004G140400--Sobic010G202200 Sobic001G286900 Sobic001G286900 Sobic004G140400--Sobic001G286900 Sobic003G238250 Sobic003G238250 Sobic004G140400--Sobic003G238250 Sobic002G257001 Sobic002G257001 Sobic004G140400--Sobic002G257001 Sobic004G178700--Sobic002G102300 Sobic004G178700--Sobic004G140400 Sobic004G178700--Sobic003G392275 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic004G178700--Sobic010G006800 Sobic010G134700 Sobic010G134700 Sobic004G178700--Sobic010G134700 Sobic004G178700--Sobic001G270700 Sobic004G178700--Sobic003G238250 Sobic004G178700--Sobic005G171700 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic004G178700--Sobic004G098800 Sobic001G270700--Sobic004G140400 Sobic008G155500 Sobic008G155500 Sobic001G270700--Sobic008G155500 Sobic001G270700--Sobic002G304801 Sobic001G270700--Sobic008G056800 Sobic008G057600 Sobic008G057600 Sobic001G270700--Sobic008G057600 Sobic001G270700--Sobic010G202200 Sobic001G270700--Sobic001G226900 Sobic010G024400 Sobic010G024400 Sobic001G270700--Sobic010G024400 Sobic001G270700--Sobic002G102300 Sobic001G490950--Sobic002G102300 Sobic001G490950--Sobic010G006800 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic001G490950--Sobic004G074900 Sobic001G490950--Sobic007G101600 Sobic001G490950--Sobic003G392275 Sobic001G490950--Sobic003G238250 Sobic001G490950--Sobic001G226900 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic001G490950--Sobic002G368100 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic001G490950--Sobic007G138000 Sobic002G102300--Sobic010G006800 Sobic002G102300--Sobic007G101600 Sobic002G102300--Sobic003G238250 Sobic002G102300--Sobic001G490950 Sobic002G102300--Sobic004G074900 Sobic002G102300--Sobic003G392275 Sobic002G102300--Sobic004G140400 Sobic002G102300--Sobic001G286900 Sobic002G102300--Sobic007G138000 Sobic003G392275--Sobic002G102300 Sobic003G392275--Sobic001G226900 Sobic003G392275--Sobic001G490950 Sobic003G392275--Sobic010G006800 Sobic003G392275--Sobic007G101600 Sobic003G392275--Sobic004G074900 Sobic003G392275--Sobic003G238250 Sobic003G392275--Sobic004G098800 Sobic003G392275--Sobic008G057600 Sobic001G226900--Sobic008G057600 Sobic001G226900--Sobic003G392275 Sobic001G226900--Sobic001G490950 Sobic001G226900--Sobic008G056800 Sobic001G226900--Sobic002G304801 Sobic001G226900--Sobic002G102300 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic001G226900--Sobic002G099700 Sobic001G226900--Sobic010G006800 Sobic001G226900--Sobic004G074900 Sobic008G056800--Sobic002G304801 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic008G056800--Sobic003G428500 Sobic008G056800--Sobic002G099700 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G056800--Sobic001G021200 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic008G056800--Sobic008G168500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic008G056800--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic008G056800--Sobic005G058000 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic008G056800--Sobic002G014300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic008G056800--Sobic008G088500
Octagon: transcription factors


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