Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G048400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1D0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G191300 - -
2 Sobic.010G026200 Sec1 family transport protein, putative, expressed K15292: STXBP1, syntaxin-binding protein 1
3 Sobic.002G429000 pyruvate decarboxylase isozyme 2, putative, expressed K01568: PDC, pyruvate decarboxylase
4 Sobic.002G402900 expressed protein -
5 Sobic.008G121600 - -
6 Sobic.002G223650 - -
7 Sobic.005G192000 receptor kinase, putative, expressed -
8 Sobic.002G210150 - -
9 Sobic.002G330200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
10 Sobic.010G157900 - -
11 Sobic.007G148600 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K06269: serine/threonine-protein phosphatase PP1 catalytic subunit
12 Sobic.002G061732 - -
13 Sobic.004G057000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G274100 THION44 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
15 Sobic.005G181500 expressed protein -
16 Sobic.002G021500 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G154400 emp24/gp25L/p24 family protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G158050 - -
19 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G236400 glutaredoxin, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G048400 Sobic003G048400 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic003G048400--Sobic003G191300 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic003G048400--Sobic010G026200 Sobic002G429000 Sobic002G429000 Sobic003G048400--Sobic002G429000 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic003G048400--Sobic002G402900 Sobic008G121600 Sobic008G121600 Sobic003G048400--Sobic008G121600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic003G048400--Sobic002G223650 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic003G048400--Sobic005G192000 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic003G048400--Sobic002G210150 Sobic002G330200 Sobic002G330200 Sobic003G048400--Sobic002G330200 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic003G191300--Sobic005G201501 Sobic003G191300--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic003G191300--Sobic005G077001 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic003G191300--Sobic005G058600 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic003G191300--Sobic003G075300 Sobic003G191300--Sobic008G121600 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic003G191300--Sobic001G435300 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic003G191300--Sobic008G169101 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G191300--Sobic004G258000 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic010G026200--Sobic004G160000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic010G026200--Sobic006G018701 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic010G026200--Sobic004G327000 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic010G026200--Sobic004G059200 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic010G026200--Sobic003G343300 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic010G026200--Sobic003G343000 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic010G026200--Sobic002G406801 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic010G026200--Sobic007G195000 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic010G026200--Sobic001G392650 Sobic002G429000--Sobic002G210150 Sobic002G429000--Sobic005G192000 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic002G429000--Sobic010G034200 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic002G429000--Sobic009G227500 Sobic006G219700 Sobic006G219700 Sobic002G429000--Sobic006G219700 Sobic009G259600 Sobic009G259600 Sobic002G429000--Sobic009G259600 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic002G429000--Sobic001G400400 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic002G429000--Sobic006G176200 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic002G429000--Sobic002G395100 Sobic002G402900--Sobic008G169101 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G435300 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic002G402900--Sobic005G191300 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G402900--Sobic007G042800 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic002G402900--Sobic001G525600 Sobic002G402900--Sobic005G058600 Sobic002G402900--Sobic002G223650 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic002G402900--Sobic007G197000 Sobic009G253700 Sobic009G253700 Sobic008G121600--Sobic009G253700 Sobic008G121600--Sobic002G402900 Sobic008G121600--Sobic001G529800 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic008G121600--Sobic010G257800 Sobic008G121600--Sobic010G034200 Sobic008G121600--Sobic002G210150 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic008G121600--Sobic006G234400 Sobic009G044100 Sobic009G044100 Sobic008G121600--Sobic009G044100 Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic008G121600--Sobic005G181500 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic002G223650--Sobic003G274100 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic002G223650--Sobic006G276801 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic002G223650--Sobic003G250160 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic002G223650--Sobic007G081701 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic002G223650--Sobic001G467400 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic002G223650--Sobic009G177750 Sobic002G223650--Sobic004G258000 Sobic002G223650--Sobic007G042800 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic002G223650--Sobic004G075250 Sobic005G192000--Sobic002G210150 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic005G192000--Sobic002G323200 Sobic005G192000--Sobic010G034200 Sobic005G192000--Sobic002G429000 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic005G192000--Sobic009G166000 Sobic005G192000--Sobic009G227500 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic005G192000--Sobic004G331500 Sobic005G192000--Sobic001G400400 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic005G192000--Sobic005G209300 Sobic002G210150--Sobic005G192000 Sobic002G210150--Sobic010G034200 Sobic002G210150--Sobic006G219700 Sobic002G210150--Sobic001G400400 Sobic002G210150--Sobic009G227500 Sobic002G210150--Sobic002G395100 Sobic002G210150--Sobic009G259600 Sobic002G210150--Sobic002G429000 Sobic002G210150--Sobic009G166000 Sobic002G330200--Sobic001G392650 Sobic002G021500 Sobic002G021500 Sobic002G330200--Sobic002G021500 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic002G330200--Sobic002G049700 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic002G330200--Sobic007G139300 Sobic002G330200--Sobic002G406801 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic002G330200--Sobic009G158300 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic002G330200--Sobic002G279900 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic002G330200--Sobic004G099200 Sobic002G330200--Sobic001G525600
Octagon: transcription factors


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