Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G226900.1
Synonym
Functional annotation zinc finger family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S7G3
Pfam PF14624 PF17123 PF00092
Panther DB PTHR10579 PTHR10579:SF51
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60710 : Zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g32750.1 : zinc finger family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G086310.1 , HORVU1Hr1G092690.1 , HORVU5Hr1G076190.1 , HORVU5Hr1G076190.2
Wheat TraesCS4D02G351600 , TraesCS5B02G338500 , TraesCS1D02G433500 , TraesCS3A02G393700 , TraesCS2D02G459400 , TraesCS7A02G423300 , TraesCS5A02G513000 , TraesCS1A02G421500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G057600 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G392275 - -
3 Sobic.001G490950 - -
4 Sobic.008G056800 expressed protein -
5 Sobic.002G304801 - -
6 Sobic.002G102300 - -
7 Sobic.002G099700 OsFBX195 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G006800 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
9 Sobic.004G074900 serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B subunitbeta, putative, expressed K11583: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B''
10 Sobic.010G141201 - -
11 Sobic.002G368100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@COBRA, putative, expressed -
12 Sobic.001G270700 nodulin, putative, expressed -
13 Sobic.001G015000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@nuclear antigen, putative, expressed -
14 Sobic.007G101600 - -
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16 Sobic.003G238250 - -
17 Sobic.003G356850 - -
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19 Sobic.008G155500 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
20 Sobic.005G134000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic008G057600 Sobic008G057600 Sobic001G226900--Sobic008G057600 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic001G226900--Sobic003G392275 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic001G226900--Sobic001G490950 Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic001G226900--Sobic008G056800 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic001G226900--Sobic002G304801 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic001G226900--Sobic002G102300 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic001G226900--Sobic002G099700 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic001G226900--Sobic010G006800 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic001G226900--Sobic004G074900 Sobic008G057600--Sobic002G304801 Sobic010G141201 Sobic010G141201 Sobic008G057600--Sobic010G141201 Sobic008G057600--Sobic008G056800 Sobic010G064200 Sobic010G064200 Sobic008G057600--Sobic010G064200 Sobic002G188300 Sobic002G188300 Sobic008G057600--Sobic002G188300 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic008G057600--Sobic002G204500 Sobic008G057600--Sobic001G226900 Sobic008G057600--Sobic002G099700 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic008G057600--Sobic006G170500 Sobic003G392275--Sobic002G102300 Sobic003G392275--Sobic001G226900 Sobic003G392275--Sobic001G490950 Sobic003G392275--Sobic010G006800 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic003G392275--Sobic007G101600 Sobic003G392275--Sobic004G074900 Sobic003G238250 Sobic003G238250 Sobic003G392275--Sobic003G238250 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic003G392275--Sobic004G098800 Sobic003G392275--Sobic008G057600 Sobic001G490950--Sobic002G102300 Sobic001G490950--Sobic010G006800 Sobic001G490950--Sobic004G074900 Sobic001G490950--Sobic007G101600 Sobic001G490950--Sobic003G392275 Sobic001G490950--Sobic003G238250 Sobic001G490950--Sobic001G226900 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic001G490950--Sobic002G368100 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic001G490950--Sobic007G138000 Sobic008G056800--Sobic002G304801 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic008G056800--Sobic003G428500 Sobic008G056800--Sobic002G099700 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G056800--Sobic001G021200 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic008G056800--Sobic008G168500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic008G056800--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic008G056800--Sobic005G058000 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic008G056800--Sobic002G014300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic008G056800--Sobic008G088500 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic002G304801--Sobic007G082300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic002G304801--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic002G304801--Sobic004G086900 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic002G304801--Sobic005G007200 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic002G099700 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic002G304801--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic002G304801--Sobic007G167950 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic002G304801--Sobic010G196700 Sobic002G102300--Sobic010G006800 Sobic002G102300--Sobic007G101600 Sobic002G102300--Sobic003G238250 Sobic002G102300--Sobic001G490950 Sobic002G102300--Sobic004G074900 Sobic002G102300--Sobic003G392275 Sobic004G140400 Sobic004G140400 Sobic002G102300--Sobic004G140400 Sobic001G286900 Sobic001G286900 Sobic002G102300--Sobic001G286900 Sobic002G102300--Sobic007G138000 Sobic002G099700--Sobic002G304801 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic002G099700--Sobic001G136000 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic002G099700--Sobic002G080450 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G099700--Sobic009G060100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic002G099700--Sobic010G129450 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G099700--Sobic007G128000 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic002G099700--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G099700--Sobic007G082100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G099700--Sobic004G168200 Sobic010G006800--Sobic003G238250 Sobic010G006800--Sobic007G101600 Sobic010G006800--Sobic002G102300 Sobic010G006800--Sobic001G490950 Sobic010G006800--Sobic004G074900 Sobic010G006800--Sobic007G138000 Sobic010G006800--Sobic001G286900 Sobic010G006800--Sobic008G057600 Sobic010G006800--Sobic003G392275 Sobic004G074900--Sobic007G101600 Sobic008G141600 Sobic008G141600 Sobic004G074900--Sobic008G141600 Sobic004G074900--Sobic003G238250 Sobic004G074900--Sobic002G102300 Sobic004G074900--Sobic001G286900 Sobic006G267100 Sobic006G267100 Sobic004G074900--Sobic006G267100 Sobic004G038500 Sobic004G038500 Sobic004G074900--Sobic004G038500 Sobic004G074900--Sobic007G138000 Sobic004G074900--Sobic010G006800
Octagon: transcription factors


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