Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G141201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSZ0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G23890 : topoisomerase II
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g47150.1 : DNA topoisomerase 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G304801 - -
2 Sobic.001G364300 - -
3 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G058000 expressed protein -
5 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -
6 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
7 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -
8 Sobic.002G298600 LTPL63 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
9 Sobic.008G095500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
10 Sobic.010G202400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
11 Sobic.005G058200 expressed protein -
12 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
13 Sobic.008G177001 - -
14 Sobic.003G428500 expressed protein -
15 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.004G086900 - -
17 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
18 Sobic.001G241700 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
20 Sobic.005G041500 OsProCP5 - Putative Lysosomal Pro-x Carboxypeptidase homologue, expressed K01285: lysosomal Pro-X carboxypeptidase


Gene co-expression network
sample Sobic010G141201 Sobic010G141201 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic010G141201--Sobic002G304801 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic010G141201--Sobic001G364300 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic010G141201--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic010G141201--Sobic005G058000 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic010G141201--Sobic008G088500 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic010G141201--Sobic008G168500 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic010G141201--Sobic001G021200 Sobic002G298600 Sobic002G298600 Sobic010G141201--Sobic002G298600 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic010G141201--Sobic008G095500 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic002G304801--Sobic007G082300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic002G304801--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic002G304801--Sobic004G086900 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic002G304801--Sobic005G007200 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic007G110800 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic002G304801--Sobic002G099700 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic002G304801--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic002G304801--Sobic007G167950 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic002G304801--Sobic010G196700 Sobic001G364300--Sobic005G058200 Sobic001G364300--Sobic008G088500 Sobic001G364300--Sobic008G168500 Sobic001G364300--Sobic005G007200 Sobic001G364300--Sobic002G096600 Sobic001G364300--Sobic005G058000 Sobic001G364300--Sobic007G082300 Sobic001G364300--Sobic004G086900 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic001G364300--Sobic008G177001 Sobic002G096600--Sobic005G058000 Sobic002G096600--Sobic008G168500 Sobic002G096600--Sobic008G088500 Sobic002G096600--Sobic001G021200 Sobic002G096600--Sobic001G364300 Sobic002G096600--Sobic005G007200 Sobic002G096600--Sobic008G095500 Sobic002G096600--Sobic005G058200 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic002G096600--Sobic010G202400 Sobic005G058000--Sobic002G096600 Sobic005G058000--Sobic008G168500 Sobic005G058000--Sobic008G088500 Sobic005G058000--Sobic001G021200 Sobic005G058000--Sobic001G364300 Sobic005G058000--Sobic005G007200 Sobic005G058000--Sobic008G095500 Sobic005G058000--Sobic005G058200 Sobic005G058000--Sobic010G202400 Sobic008G088500--Sobic008G168500 Sobic008G088500--Sobic001G364300 Sobic008G088500--Sobic002G096600 Sobic008G088500--Sobic005G058000 Sobic008G088500--Sobic005G058200 Sobic008G088500--Sobic005G007200 Sobic008G088500--Sobic001G021200 Sobic008G088500--Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G177001 Sobic008G168500--Sobic008G088500 Sobic008G168500--Sobic002G096600 Sobic008G168500--Sobic005G058000 Sobic008G168500--Sobic001G364300 Sobic008G168500--Sobic005G058200 Sobic008G168500--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic001G021200 Sobic008G168500--Sobic008G095500 Sobic008G168500--Sobic008G177001 Sobic001G021200--Sobic005G058000 Sobic001G021200--Sobic002G096600 Sobic001G021200--Sobic008G168500 Sobic001G021200--Sobic008G088500 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic001G021200--Sobic003G428500 Sobic001G021200--Sobic008G095500 Sobic001G021200--Sobic001G364300 Sobic001G021200--Sobic010G202400 Sobic001G021200--Sobic005G007200 Sobic004G335400 Sobic004G335400 Sobic002G298600--Sobic004G335400 Sobic002G019300 Sobic002G019300 Sobic002G298600--Sobic002G019300 Sobic005G041500 Sobic005G041500 Sobic002G298600--Sobic005G041500 Sobic006G276600 Sobic006G276600 Sobic002G298600--Sobic006G276600 Sobic009G149100 Sobic009G149100 Sobic002G298600--Sobic009G149100 Sobic004G254700 Sobic004G254700 Sobic002G298600--Sobic004G254700 Sobic001G241700 Sobic001G241700 Sobic002G298600--Sobic001G241700 Sobic002G298600--Sobic001G021200 Sobic002G298600--Sobic010G202400 Sobic008G095500--Sobic008G088500 Sobic008G095500--Sobic008G168500 Sobic008G095500--Sobic002G096600 Sobic008G095500--Sobic005G058000 Sobic008G095500--Sobic001G364300 Sobic008G095500--Sobic005G058200 Sobic008G095500--Sobic001G021200 Sobic008G095500--Sobic005G007200 Sobic008G095500--Sobic008G177001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.