Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G011100.1
Synonym Sb02g001180
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X7V2
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19090 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g42340.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G194000 Alg9-like mannosyltransferase protein, putative, expressed K05286: GPI mannosyltransferase 3
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9 Sobic.002G398700 tim44-like domain containing protein, expressed K17426: large subunit ribosomal protein L45
10 Sobic.002G386900 pseudouridylate synthase, putative, expressed K06176: truD, tRNA pseudouridine13 synthase
11 Sobic.010G264000 expressed protein(PubMedID : 28640841)@expressed protein -
12 Sobic.006G281700 DUF803 domain containing, putative, expressed -
13 Sobic.005G114500 growth regulator related protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G141800 expressed protein -
15 Sobic.009G122500 expressed protein -
16 Sobic.006G245900 FAR1 family protein, expressed -
17 Sobic.006G262700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G191200 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
19 Sobic.005G117500 - -
20 Sobic.001G308400 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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