Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G115500.5,Sobic.002G115500.4
Synonym
Functional annotation PHD finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W3C0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035663
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G115500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G040800 helicase, putative, expressed K10844: ERCC2, DNA excision repair protein ERCC-2
2 Sobic.009G000400 expressed protein -
3 Sobic.009G260650 - -
4 Sobic.006G281700 DUF803 domain containing, putative, expressed -
5 Sobic.005G040900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10601: SYVN1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin
6 Sobic.009G122500 expressed protein -
7 Sobic.003G240700 peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin, putative, expressed -
8 Sobic.006G224300 APO, putative, expressed -
9 Sobic.004G345400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K05757: actin related protein 2/3 complex, subunit 1A/1B
10 Sobic.006G091000 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K13617: protein phosphatase methylesterase 1
11 Sobic.001G308400 expressed protein -
12 Sobic.001G179200 expressed protein -
13 Sobic.009G129600 ABTB1 - Armadillo repeats with a Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed -
14 Sobic.010G074900 G protein coupled receptor, putative, expressed -
15 Sobic.010G278600 FG-GAP repeat-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G193100 expressed protein -
17 Sobic.003G393200 expressed protein -
18 Sobic.008G058800 OsFBX369 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G042200 ATP/GTP/Ca++ binding protein, putative, expressed K07870: RHOT1, mitochondrial Rho GTPase 1
20 Sobic.001G085700 STE_PAK_Ste20_KHSh_GCKh_HPKh.1 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G115500 Sobic002G115500 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic002G115500--Sobic009G040800 Sobic009G000400 Sobic009G000400 Sobic002G115500--Sobic009G000400 Sobic009G260650 Sobic009G260650 Sobic002G115500--Sobic009G260650 Sobic006G281700 Sobic006G281700 Sobic002G115500--Sobic006G281700 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic002G115500--Sobic005G040900 Sobic009G122500 Sobic009G122500 Sobic002G115500--Sobic009G122500 Sobic003G240700 Sobic003G240700 Sobic002G115500--Sobic003G240700 Sobic006G224300 Sobic006G224300 Sobic002G115500--Sobic006G224300 Sobic004G345400 Sobic004G345400 Sobic002G115500--Sobic004G345400 Sobic010G278600 Sobic010G278600 Sobic009G040800--Sobic010G278600 Sobic006G091000 Sobic006G091000 Sobic009G040800--Sobic006G091000 Sobic009G040800--Sobic005G040900 Sobic009G129600 Sobic009G129600 Sobic009G040800--Sobic009G129600 Sobic001G335900 Sobic001G335900 Sobic009G040800--Sobic001G335900 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic009G040800--Sobic008G149800 Sobic004G246100 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Octagon: transcription factors


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