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Transcriptome id Sobic.005G117500.4,Sobic.005G117500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PRV9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G007100 AAA family ATPase, putative, expressed K14571: RIX7, ribosome biogenesis ATPase
2 Sobic.002G235200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G014500 RNA recognition motif containing protein, expressed K13161: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
4 Sobic.001G515000 protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase. tax, putative, expressed K00587: ICMT, protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase
5 Sobic.006G267600 elongation factor Tu, putative, expressed K14416: elongation factor 1 alpha-like protein
6 Sobic.005G137700 OsFBX409 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G309900 cold-induced protein, putative, expressed K13174: THO complex subunit 5
8 Sobic.001G393900 FAD binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G188400 glutamate dehydrogenase protein, putative, expressed K00262: E1.4.1.4, glutamate dehydrogenase (NADP+)
10 Sobic.010G166400 initiator tRNA phosphoribosyl transferase family protein, putative, expressed K15463: tRNA A64-2'-O-ribosylphosphate transferase
11 Sobic.006G281700 DUF803 domain containing, putative, expressed -
12 Sobic.008G147200 tubulin, putative, expressed -
13 Sobic.006G261400 peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases, putative, expressed -
14 Sobic.001G362200 DHHC zinc finger domain containing protein, expressed K18932: palmitoyltransferase
15 Sobic.007G183900 ubiquitin family protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G088875 - -
17 Sobic.002G145800 flowering time control protein FCA, putative, expressed -
18 Sobic.003G006400 metallo-beta-lactamase family protein, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
19 Sobic.002G048700 BT1 family protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q


Gene co-expression network
sample Sobic005G117500 Sobic005G117500 Sobic010G007100 Sobic010G007100 Sobic005G117500--Sobic010G007100 Sobic002G235200 Sobic002G235200 Sobic005G117500--Sobic002G235200 Sobic008G014500 Sobic008G014500 Sobic005G117500--Sobic008G014500 Sobic001G515000 Sobic001G515000 Sobic005G117500--Sobic001G515000 Sobic006G267600 Sobic006G267600 Sobic005G117500--Sobic006G267600 Sobic005G137700 Sobic005G137700 Sobic005G117500--Sobic005G137700 Sobic004G309900 Sobic004G309900 Sobic005G117500--Sobic004G309900 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic005G117500--Sobic001G393900 Sobic003G188400 Sobic003G188400 Sobic005G117500--Sobic003G188400 Sobic001G145400 Sobic001G145400 Sobic010G007100--Sobic001G145400 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic010G007100--Sobic008G147200 Sobic004G340400 Sobic004G340400 Sobic010G007100--Sobic004G340400 Sobic006G086600 Sobic006G086600 Sobic010G007100--Sobic006G086600 Sobic010G007100--Sobic005G137700 Sobic006G077200 Sobic006G077200 Sobic010G007100--Sobic006G077200 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Octagon: transcription factors


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