Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G036400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PB44
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G237650 - -
2 Sobic.008G112100 Phospholipid synthesis protein 1 PLS1 (Zm)(PubMedID : 27208977)@acyltransferase, putative, expressed K13523: lysophosphatidic acid acyltransferase / lysophosphatidylinositol acyltransferase
3 Sobic.003G304800 OsRhmbd4 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
4 Sobic.005G123400 expressed protein -
5 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -
6 Sobic.004G185500 extracellular ligand-gated ion channel, putative, expressed -
7 Sobic.005G040900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10601: SYVN1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin
8 Sobic.010G153000 expressed protein -
9 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
10 Sobic.004G194100 expressed protein -
11 Sobic.006G262700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
12 Sobic.007G070300 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.009G040800 helicase, putative, expressed K10844: ERCC2, DNA excision repair protein ERCC-2
14 Sobic.001G242300 expressed protein -
15 Sobic.006G066000 - -
16 Sobic.002G342300 exostosin family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G116400 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.009G155400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.002G203600 protein binding protein, putative, expressed K11975: E3 ubiquitin-protein ligase RNF144
20 Sobic.006G144000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G036400 Sobic008G036400 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic008G036400--Sobic010G237650 Sobic008G112100 Sobic008G112100 Sobic008G036400--Sobic008G112100 Sobic003G304800 Sobic003G304800 Sobic008G036400--Sobic003G304800 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic008G036400--Sobic005G123400 Sobic005G216800 Sobic005G216800 Sobic008G036400--Sobic005G216800 Sobic004G185500 Sobic004G185500 Sobic008G036400--Sobic004G185500 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic008G036400--Sobic005G040900 Sobic010G153000 Sobic010G153000 Sobic008G036400--Sobic010G153000 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic008G036400--Sobic003G397100 Sobic002G033600 Sobic002G033600 Sobic010G237650--Sobic002G033600 Sobic003G092066 Sobic003G092066 Sobic010G237650--Sobic003G092066 Sobic002G268900 Sobic002G268900 Sobic010G237650--Sobic002G268900 Sobic006G144000 Sobic006G144000 Sobic010G237650--Sobic006G144000 Sobic007G139400 Sobic007G139400 Sobic010G237650--Sobic007G139400 Sobic006G215100 Sobic006G215100 Sobic010G237650--Sobic006G215100 Sobic010G073600 Sobic010G073600 Sobic010G237650--Sobic010G073600 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic010G237650--Sobic005G128000 Sobic009G102000 Sobic009G102000 Sobic010G237650--Sobic009G102000 Sobic009G054400 Sobic009G054400 Sobic008G112100--Sobic009G054400 Sobic008G112100--Sobic003G397100 Sobic007G036800 Sobic007G036800 Sobic008G112100--Sobic007G036800 Sobic007G010200 Sobic007G010200 Sobic008G112100--Sobic007G010200 Sobic001G433600 Sobic001G433600 Sobic008G112100--Sobic001G433600 Sobic008G087200 Sobic008G087200 Sobic008G112100--Sobic008G087200 Sobic002G123600 Sobic002G123600 Sobic008G112100--Sobic002G123600 Sobic004G293400 Sobic004G293400 Sobic008G112100--Sobic004G293400 Sobic001G381500 Sobic001G381500 Sobic008G112100--Sobic001G381500 Sobic009G122900 Sobic009G122900 Sobic003G304800--Sobic009G122900 Sobic003G304800--Sobic007G010200 Sobic001G472100 Sobic001G472100 Sobic003G304800--Sobic001G472100 Sobic003G304800--Sobic008G112100 Sobic003G331000 Sobic003G331000 Sobic003G304800--Sobic003G331000 Sobic003G304800--Sobic007G036800 Sobic009G060400 Sobic009G060400 Sobic003G304800--Sobic009G060400 Sobic005G160200 Sobic005G160200 Sobic003G304800--Sobic005G160200 Sobic001G425200 Sobic001G425200 Sobic003G304800--Sobic001G425200 Sobic006G237500 Sobic006G237500 Sobic005G123400--Sobic006G237500 Sobic010G112600 Sobic010G112600 Sobic005G123400--Sobic010G112600 Sobic003G393200 Sobic003G393200 Sobic005G123400--Sobic003G393200 Sobic001G043200 Sobic001G043200 Sobic005G123400--Sobic001G043200 Sobic009G227100 Sobic009G227100 Sobic005G123400--Sobic009G227100 Sobic009G252300 Sobic009G252300 Sobic005G123400--Sobic009G252300 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic005G123400--Sobic007G030100 Sobic003G190200 Sobic003G190200 Sobic005G123400--Sobic003G190200 Sobic003G368400 Sobic003G368400 Sobic005G123400--Sobic003G368400 Sobic005G216800--Sobic006G237500 Sobic005G216800--Sobic005G123400 Sobic002G342300 Sobic002G342300 Sobic005G216800--Sobic002G342300 Sobic005G216800--Sobic010G237650 Sobic002G235900 Sobic002G235900 Sobic005G216800--Sobic002G235900 Sobic005G216800--Sobic009G102000 Sobic005G216800--Sobic003G397100 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic005G216800--Sobic003G194800 Sobic006G170900 Sobic006G170900 Sobic005G216800--Sobic006G170900 Sobic005G170000 Sobic005G170000 Sobic004G185500--Sobic005G170000 Sobic006G078800 Sobic006G078800 Sobic004G185500--Sobic006G078800 Sobic004G185500--Sobic003G368400 Sobic004G043600 Sobic004G043600 Sobic004G185500--Sobic004G043600 Sobic004G185500--Sobic008G112100 Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic004G185500--Sobic008G090300 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic004G185500--Sobic006G066000 Sobic004G185500--Sobic005G216800 Sobic004G185500--Sobic005G123400 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic005G040900--Sobic009G040800 Sobic006G091000 Sobic006G091000 Sobic005G040900--Sobic006G091000 Sobic004G347100 Sobic004G347100 Sobic005G040900--Sobic004G347100 Sobic005G040900--Sobic007G139400 Sobic010G074900 Sobic010G074900 Sobic005G040900--Sobic010G074900 Sobic003G205501 Sobic003G205501 Sobic005G040900--Sobic003G205501 Sobic004G345400 Sobic004G345400 Sobic005G040900--Sobic004G345400 Sobic005G040900--Sobic001G472100 Sobic009G129600 Sobic009G129600 Sobic005G040900--Sobic009G129600 Sobic006G262700 Sobic006G262700 Sobic010G153000--Sobic006G262700 Sobic007G118075 Sobic007G118075 Sobic010G153000--Sobic007G118075 Sobic002G011100 Sobic002G011100 Sobic010G153000--Sobic002G011100 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic010G153000--Sobic009G116400 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic010G153000--Sobic005G154700 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic010G153000--Sobic004G089500 Sobic001G204700 Sobic001G204700 Sobic010G153000--Sobic001G204700 Sobic010G153000--Sobic003G397100 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic010G153000--Sobic006G028700 Sobic001G242300 Sobic001G242300 Sobic003G397100--Sobic001G242300 Sobic003G397100--Sobic002G123600 Sobic002G260700 Sobic002G260700 Sobic003G397100--Sobic002G260700 Sobic003G397100--Sobic008G090300 Sobic008G169400 Sobic008G169400 Sobic003G397100--Sobic008G169400 Sobic003G397100--Sobic008G112100 Sobic010G143600 Sobic010G143600 Sobic003G397100--Sobic010G143600 Sobic001G448100 Sobic001G448100 Sobic003G397100--Sobic001G448100 Sobic008G031200 Sobic008G031200 Sobic003G397100--Sobic008G031200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.