Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G185500.2,Sobic.004G185500.1
Synonym Sb04g023430
Functional annotation extracellular ligand-gated ion channel, putative, expressed
UniProt C5XVT3 , A0A194YRL2
Pfam PF12056
Panther DB PTHR31963 PTHR31963:SF4 PTHR31963 PTHR31963:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G20300 : Protein of unknown function (DUF3537)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g35830.1 : extracellular ligand-gated ion channel, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020748 , Zm00025a020750 , Zm00025a011194
Brachypodium KQJ82859 , KQJ99969
Barley -
Wheat TraesCS1A02G087100 , TraesCS1D02G088700 , TraesCS1B02G105700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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20 Sobic.004G068100 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic004G185500 Sobic004G185500 Sobic005G170000 Sobic005G170000 Sobic004G185500--Sobic005G170000 Sobic006G078800 Sobic006G078800 Sobic004G185500--Sobic006G078800 Sobic003G368400 Sobic003G368400 Sobic004G185500--Sobic003G368400 Sobic004G043600 Sobic004G043600 Sobic004G185500--Sobic004G043600 Sobic008G112100 Sobic008G112100 Sobic004G185500--Sobic008G112100 Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic004G185500--Sobic008G090300 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic004G185500--Sobic006G066000 Sobic005G216800 Sobic005G216800 Sobic004G185500--Sobic005G216800 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic004G185500--Sobic005G123400 Sobic007G077532 Sobic007G077532 Sobic005G170000--Sobic007G077532 Sobic008G006000 Sobic008G006000 Sobic005G170000--Sobic008G006000 Sobic010G225201 Sobic010G225201 Sobic005G170000--Sobic010G225201 Sobic007G192400 Sobic007G192400 Sobic005G170000--Sobic007G192400 Sobic005G170000--Sobic005G123400 Sobic002G203600 Sobic002G203600 Sobic005G170000--Sobic002G203600 Sobic004G016100 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Octagon: transcription factors


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