Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G067100.1
Synonym
Functional annotation ribosome inactivating protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PKM4
Pfam PF00161
Panther DB PTHR33453:SF1 PTHR33453
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0017148; negative regulation of translation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g05590.1 : ribosome inactivating protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G067100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
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12 Sobic.008G110800 - -
13 Sobic.008G090300 - -
14 Sobic.002G212800 - -
15 Sobic.004G045566 - -
16 Sobic.009G067501 - -
17 Sobic.004G291800 - -
18 Sobic.004G185500 extracellular ligand-gated ion channel, putative, expressed -
19 Sobic.005G099200 - -
20 Sobic.008G084401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic006G067100--Sobic005G128000 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic006G067100--Sobic006G066000 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic006G067100--Sobic001G261537 Sobic009G029500 Sobic009G029500 Sobic006G067100--Sobic009G029500 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic006G067100--Sobic008G106600 Sobic004G291700 Sobic004G291700 Sobic006G067100--Sobic004G291700 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic006G067100--Sobic005G099150 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic006G067100--Sobic008G091671 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic006G067100--Sobic003G159450 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic005G128000--Sobic002G073300 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic005G128000--Sobic004G045566 Sobic005G128000--Sobic001G261537 Sobic005G128000--Sobic005G099150 Sobic005G128000--Sobic006G067100 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic005G128000--Sobic002G182300 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G237650 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic005G128000--Sobic010G139301 Sobic005G128000--Sobic008G106600 Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic006G066000--Sobic008G090300 Sobic006G066000--Sobic006G067100 Sobic006G066000--Sobic005G128000 Sobic005G099200 Sobic005G099200 Sobic006G066000--Sobic005G099200 Sobic008G084401 Sobic008G084401 Sobic006G066000--Sobic008G084401 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic006G066000--Sobic008G099500 Sobic008G110800 Sobic008G110800 Sobic006G066000--Sobic008G110800 Sobic006G066000--Sobic004G291700 Sobic006G066000--Sobic001G261537 Sobic001G261537--Sobic008G106600 Sobic001G261537--Sobic005G128000 Sobic001G261537--Sobic006G067100 Sobic001G261537--Sobic002G182300 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic001G261537--Sobic009G197200 Sobic001G261537--Sobic010G139301 Sobic001G078300 Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic001G078300 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic008G091671 Sobic009G029500--Sobic006G067100 Sobic009G029500--Sobic004G291700 Sobic009G029500--Sobic003G159450 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G029500--Sobic004G291800 Sobic003G174800 Sobic003G174800 Sobic009G029500--Sobic003G174800 Sobic009G029500--Sobic001G261537 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic009G029500--Sobic007G112900 Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic009G029500--Sobic008G105300 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic009G029500--Sobic010G143200 Sobic008G106600--Sobic001G261537 Sobic008G106600--Sobic006G068400 Sobic008G106600--Sobic008G091671 Sobic008G106600--Sobic005G128000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic009G197200 Sobic008G106600--Sobic010G139301 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G106600--Sobic009G067501 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic008G106600--Sobic004G289600 Sobic004G291700--Sobic009G029500 Sobic004G291700--Sobic004G291800 Sobic004G291700--Sobic006G067100 Sobic004G291700--Sobic006G066000 Sobic004G291700--Sobic005G099150 Sobic004G291700--Sobic010G143200 Sobic004G291700--Sobic005G128000 Sobic010G015000 Sobic010G015000 Sobic004G291700--Sobic010G015000 Sobic003G061000 Sobic003G061000 Sobic004G291700--Sobic003G061000 Sobic005G099150--Sobic004G045566 Sobic005G099150--Sobic006G068400 Sobic005G099150--Sobic010G139301 Sobic005G099150--Sobic005G128000 Sobic005G099150--Sobic002G182300 Sobic005G099150--Sobic002G073300 Sobic005G099150--Sobic008G091671 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic005G099150--Sobic007G089600 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic005G099150--Sobic007G142050 Sobic008G091671--Sobic009G197200 Sobic008G091671--Sobic006G068400 Sobic008G091671--Sobic007G112900 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic004G291800 Sobic008G091671--Sobic009G067501 Sobic008G091671--Sobic003G159450 Sobic008G091671--Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic010G139301 Sobic003G159450--Sobic007G112900 Sobic003G159450--Sobic010G143200 Sobic003G159450--Sobic002G212800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic003G159450--Sobic008G125600 Sobic003G159450--Sobic008G091671 Sobic003G159450--Sobic009G067501 Sobic003G159450--Sobic004G291800 Sobic002G095900 Sobic002G095900 Sobic003G159450--Sobic002G095900 Sobic005G007700 Sobic005G007700 Sobic003G159450--Sobic005G007700
Octagon: transcription factors


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