Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G029500.4,Sobic.009G029500.5,Sobic.009G029500.2,Sobic.009G029500.3,Sobic.009G029500.6
Synonym MTPA1, ATMTPA1, Sb09g002460
Functional annotation cation efflux family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6P669 , A0A1Z5R0M5
Pfam PF01545
Panther DB PTHR11562 PTHR11562:SF31
NCBI CDD KOG1482; Zn2+ transporter
KEGG Orthology K14689; SLC30A2, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0008324cation transmembrane transporter activity GO:0006812cation transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G61940 : Cation efflux family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g03780.1 : cation efflux family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040703 , Zm00025a038173
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G082000.4 , HORVU4Hr1G082000.5 , HORVU4Hr1G082000.6 , HORVU4Hr1G082000.7 , HORVU4Hr1G082000.1 , HORVU4Hr1G082000.2 , HORVU4Hr1G082000.3
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G029500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G067100 ribosome inactivating protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G291700 CPuORF25 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K05929: E2.1.1.103, phosphoethanolamine N-methyltransferase
3 Sobic.003G159450 - -
4 Sobic.004G291800 - -
5 Sobic.003G174800 - -
6 Sobic.001G261537 - -
7 Sobic.007G112900 - -
8 Sobic.008G105300 expressed protein -
9 Sobic.010G143200 - -
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11 Sobic.002G136900 - -
12 Sobic.007G112700 - -
13 Sobic.002G212800 - -
14 Sobic.005G036700 expressed protein -
15 Sobic.010G015000 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G201966 - -
17 Sobic.006G066000 - -
18 Sobic.009G197200 - -
19 Sobic.008G000900 - -
20 Sobic.006G046000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G029500 Sobic009G029500 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic009G029500--Sobic006G067100 Sobic004G291700 Sobic004G291700 Sobic009G029500--Sobic004G291700 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic009G029500--Sobic003G159450 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G029500--Sobic004G291800 Sobic003G174800 Sobic003G174800 Sobic009G029500--Sobic003G174800 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic009G029500--Sobic001G261537 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic009G029500--Sobic007G112900 Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic009G029500--Sobic008G105300 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic009G029500--Sobic010G143200 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic006G067100--Sobic005G128000 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic006G067100--Sobic006G066000 Sobic006G067100--Sobic001G261537 Sobic006G067100--Sobic009G029500 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic006G067100--Sobic008G106600 Sobic006G067100--Sobic004G291700 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic006G067100--Sobic005G099150 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic006G067100--Sobic008G091671 Sobic006G067100--Sobic003G159450 Sobic004G291700--Sobic009G029500 Sobic004G291700--Sobic004G291800 Sobic004G291700--Sobic006G067100 Sobic004G291700--Sobic006G066000 Sobic004G291700--Sobic005G099150 Sobic004G291700--Sobic010G143200 Sobic004G291700--Sobic005G128000 Sobic010G015000 Sobic010G015000 Sobic004G291700--Sobic010G015000 Sobic003G061000 Sobic003G061000 Sobic004G291700--Sobic003G061000 Sobic003G159450--Sobic007G112900 Sobic003G159450--Sobic010G143200 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic003G159450--Sobic002G212800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic003G159450--Sobic008G125600 Sobic003G159450--Sobic008G091671 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic003G159450--Sobic009G067501 Sobic003G159450--Sobic004G291800 Sobic002G095900 Sobic002G095900 Sobic003G159450--Sobic002G095900 Sobic005G007700 Sobic005G007700 Sobic003G159450--Sobic005G007700 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic004G291800--Sobic004G020401 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic004G291800--Sobic009G197200 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic004G291800--Sobic009G110366 Sobic004G291800--Sobic002G212800 Sobic004G291800--Sobic007G112900 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic004G291800--Sobic009G109450 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic004G291800--Sobic007G130100 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic004G291800--Sobic006G273100 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic004G291800--Sobic003G057800 Sobic008G000900 Sobic008G000900 Sobic003G174800--Sobic008G000900 Sobic001G087100 Sobic001G087100 Sobic003G174800--Sobic001G087100 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic003G174800--Sobic006G214400 Sobic003G174800--Sobic010G143200 Sobic007G043900 Sobic007G043900 Sobic003G174800--Sobic007G043900 Sobic004G175600 Sobic004G175600 Sobic003G174800--Sobic004G175600 Sobic001G485600 Sobic001G485600 Sobic003G174800--Sobic001G485600 Sobic001G043400 Sobic001G043400 Sobic003G174800--Sobic001G043400 Sobic010G268300 Sobic010G268300 Sobic003G174800--Sobic010G268300 Sobic001G261537--Sobic008G106600 Sobic001G261537--Sobic005G128000 Sobic001G261537--Sobic006G067100 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic009G197200 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic001G261537--Sobic010G139301 Sobic001G078300 Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic001G078300 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic008G091671 Sobic007G112900--Sobic002G212800 Sobic007G112900--Sobic003G159450 Sobic007G112900--Sobic010G143200 Sobic007G112900--Sobic004G291800 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic007G112900--Sobic006G046000 Sobic001G394400 Sobic001G394400 Sobic007G112900--Sobic001G394400 Sobic007G112900--Sobic008G091671 Sobic007G112900--Sobic008G125600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G112900--Sobic009G104300 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic008G105300--Sobic004G143400 Sobic008G110800 Sobic008G110800 Sobic008G105300--Sobic008G110800 Sobic008G105850 Sobic008G105850 Sobic008G105300--Sobic008G105850 Sobic009G001800 Sobic009G001800 Sobic008G105300--Sobic009G001800 Sobic008G105300--Sobic009G029500 Sobic008G105300--Sobic006G067100 Sobic008G105300--Sobic001G261537 Sobic008G117800 Sobic008G117800 Sobic008G105300--Sobic008G117800 Sobic001G201966 Sobic001G201966 Sobic008G105300--Sobic001G201966 Sobic010G143200--Sobic007G112900 Sobic010G143200--Sobic003G159450 Sobic001G261496 Sobic001G261496 Sobic010G143200--Sobic001G261496 Sobic001G191100 Sobic001G191100 Sobic010G143200--Sobic001G191100 Sobic010G143200--Sobic008G000900 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic010G143200--Sobic004G096500 Sobic010G143200--Sobic008G125600 Sobic010G143200--Sobic008G091671 Sobic009G178800 Sobic009G178800 Sobic010G143200--Sobic009G178800
Octagon: transcription factors


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