Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G261537.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDN4 , A0A120GUS5 , A0A109NDS1 , A0A109NDL1 , A0A120GUV2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G106600 - -
2 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
3 Sobic.006G067100 ribosome inactivating protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G182300 - -
5 Sobic.009G197200 - -
6 Sobic.010G139301 - -
7 Sobic.001G078300 nucleoporin p58/p45, putative, expressed K14307: NUPL1, nucleoporin p58/p45
8 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
9 Sobic.008G091671 - -
10 Sobic.005G064700 expressed protein -
11 Sobic.004G045566 - -
12 Sobic.003G031750 - -
13 Sobic.008G068400 - -
14 Sobic.004G089500 - -
15 Sobic.002G073300 - -
16 Sobic.006G066000 - -
17 Sobic.005G099150 - -
18 Sobic.007G090701 - -
19 Sobic.003G156766 - -
20 Sobic.010G173900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic001G261537--Sobic008G106600 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic001G261537--Sobic005G128000 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic001G261537--Sobic006G067100 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic002G182300 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic001G261537--Sobic009G197200 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic001G261537--Sobic010G139301 Sobic001G078300 Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic001G078300 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic006G068400 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic001G261537--Sobic008G091671 Sobic008G106600--Sobic001G261537 Sobic008G106600--Sobic006G068400 Sobic008G106600--Sobic008G091671 Sobic008G106600--Sobic005G128000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic009G197200 Sobic008G106600--Sobic010G139301 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G106600--Sobic009G067501 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic008G106600--Sobic004G289600 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic005G128000--Sobic002G073300 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic005G128000--Sobic004G045566 Sobic005G128000--Sobic001G261537 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic005G128000--Sobic005G099150 Sobic005G128000--Sobic006G067100 Sobic005G128000--Sobic002G182300 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G139301 Sobic005G128000--Sobic008G106600 Sobic006G067100--Sobic005G128000 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic006G067100--Sobic006G066000 Sobic006G067100--Sobic001G261537 Sobic009G029500 Sobic009G029500 Sobic006G067100--Sobic009G029500 Sobic006G067100--Sobic008G106600 Sobic004G291700 Sobic004G291700 Sobic006G067100--Sobic004G291700 Sobic006G067100--Sobic005G099150 Sobic006G067100--Sobic008G091671 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic006G067100--Sobic003G159450 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G182300--Sobic004G169501 Sobic002G182300--Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic002G073300 Sobic002G182300--Sobic005G099150 Sobic002G182300--Sobic004G045566 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G124200 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G182300--Sobic002G181450 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G182300--Sobic007G142050 Sobic002G182300--Sobic006G068400 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G197200--Sobic004G291800 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G197200--Sobic004G020401 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G197200--Sobic009G110366 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic009G197200--Sobic009G109450 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic008G068400 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic009G197200--Sobic006G273100 Sobic009G197200--Sobic008G091671 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic010G144100 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic009G197200--Sobic002G212800 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic007G142050 Sobic010G139301--Sobic004G169501 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic002G073300 Sobic010G139301--Sobic002G182300 Sobic010G139301--Sobic005G099150 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic010G139301--Sobic008G068800 Sobic001G078300--Sobic001G261537 Sobic001G087100 Sobic001G087100 Sobic001G078300--Sobic001G087100 Sobic003G156766 Sobic003G156766 Sobic001G078300--Sobic003G156766 Sobic001G078300--Sobic008G106600 Sobic001G078300--Sobic005G064700 Sobic001G078300--Sobic009G197200 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic001G078300--Sobic007G066050 Sobic001G078300--Sobic008G091671 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic001G078300--Sobic001G164200 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic006G068400--Sobic002G056100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic006G068400--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic010G139301 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic006G068400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic006G068400--Sobic001G305400 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic006G068400--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic006G068400--Sobic005G221425 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G068400--Sobic008G079100 Sobic008G091671--Sobic009G197200 Sobic008G091671--Sobic006G068400 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic004G291800 Sobic008G091671--Sobic009G067501 Sobic008G091671--Sobic003G159450 Sobic008G091671--Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic010G139301
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.