Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G090701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R8V6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G261537 - -
2 Sobic.010G046400 glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase, putative, expressed -
3 Sobic.001G009400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.001G187800 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
5 Sobic.003G156766 - -
6 Sobic.009G155400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.006G100000 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G344500 pentatricopeptide, putative, expressed K18213: proteinaceous RNase P
10 Sobic.007G087900 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
11 Sobic.004G089500 - -
12 Sobic.009G116400 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.001G247200 - -
14 Sobic.010G173900 expressed protein -
15 Sobic.003G142700 expressed protein -
16 Sobic.008G066900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.003G128000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.010G209700 expressed protein -
19 Sobic.008G106600 - -
20 Sobic.009G040800 helicase, putative, expressed K10844: ERCC2, DNA excision repair protein ERCC-2


Gene co-expression network
sample Sobic007G090701 Sobic007G090701 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic007G090701--Sobic001G261537 Sobic010G046400 Sobic010G046400 Sobic007G090701--Sobic010G046400 Sobic001G009400 Sobic001G009400 Sobic007G090701--Sobic001G009400 Sobic001G187800 Sobic001G187800 Sobic007G090701--Sobic001G187800 Sobic003G156766 Sobic003G156766 Sobic007G090701--Sobic003G156766 Sobic009G155400 Sobic009G155400 Sobic007G090701--Sobic009G155400 Sobic006G100000 Sobic006G100000 Sobic007G090701--Sobic006G100000 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic007G090701--Sobic005G154700 Sobic002G344500 Sobic002G344500 Sobic007G090701--Sobic002G344500 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic001G261537--Sobic008G106600 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic001G261537--Sobic005G128000 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic001G261537--Sobic006G067100 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic002G182300 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic001G261537--Sobic009G197200 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic001G261537--Sobic010G139301 Sobic001G078300 Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic001G078300 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic006G068400 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic001G261537--Sobic008G091671 Sobic010G173900 Sobic010G173900 Sobic010G046400--Sobic010G173900 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic010G046400--Sobic004G227500 Sobic002G334600 Sobic002G334600 Sobic010G046400--Sobic002G334600 Sobic002G218700 Sobic002G218700 Sobic010G046400--Sobic002G218700 Sobic007G070300 Sobic007G070300 Sobic010G046400--Sobic007G070300 Sobic002G367300 Sobic002G367300 Sobic010G046400--Sobic002G367300 Sobic009G011500 Sobic009G011500 Sobic010G046400--Sobic009G011500 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic010G046400--Sobic008G099500 Sobic001G247200 Sobic001G247200 Sobic010G046400--Sobic001G247200 Sobic001G009400--Sobic001G187800 Sobic001G009400--Sobic009G155400 Sobic003G128000 Sobic003G128000 Sobic001G009400--Sobic003G128000 Sobic009G096100 Sobic009G096100 Sobic001G009400--Sobic009G096100 Sobic001G009400--Sobic007G090701 Sobic004G217900 Sobic004G217900 Sobic001G009400--Sobic004G217900 Sobic003G419800 Sobic003G419800 Sobic001G009400--Sobic003G419800 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic001G009400--Sobic009G116400 Sobic001G391101 Sobic001G391101 Sobic001G009400--Sobic001G391101 Sobic001G187800--Sobic001G009400 Sobic001G187800--Sobic009G155400 Sobic001G448100 Sobic001G448100 Sobic001G187800--Sobic001G448100 Sobic006G111200 Sobic006G111200 Sobic001G187800--Sobic006G111200 Sobic001G187800--Sobic004G217900 Sobic006G262700 Sobic006G262700 Sobic001G187800--Sobic006G262700 Sobic009G108400 Sobic009G108400 Sobic001G187800--Sobic009G108400 Sobic001G347100 Sobic001G347100 Sobic001G187800--Sobic001G347100 Sobic005G011000 Sobic005G011000 Sobic001G187800--Sobic005G011000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic003G156766--Sobic008G013900 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic003G156766--Sobic005G148400 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic003G156766--Sobic005G127300 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic003G156766--Sobic001G164200 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic003G156766--Sobic007G129401 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic003G156766--Sobic009G026400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic003G156766--Sobic002G060500 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic003G156766--Sobic003G176100 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic003G156766--Sobic008G049000 Sobic009G155400--Sobic009G116400 Sobic008G163400 Sobic008G163400 Sobic009G155400--Sobic008G163400 Sobic004G241000 Sobic004G241000 Sobic009G155400--Sobic004G241000 Sobic006G085900 Sobic006G085900 Sobic009G155400--Sobic006G085900 Sobic009G155400--Sobic004G217900 Sobic006G069100 Sobic006G069100 Sobic009G155400--Sobic006G069100 Sobic002G172500 Sobic002G172500 Sobic009G155400--Sobic002G172500 Sobic009G155400--Sobic006G262700 Sobic005G210700 Sobic005G210700 Sobic009G155400--Sobic005G210700 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic006G100000--Sobic009G040800 Sobic009G015800 Sobic009G015800 Sobic006G100000--Sobic009G015800 Sobic003G442000 Sobic003G442000 Sobic006G100000--Sobic003G442000 Sobic010G209700 Sobic010G209700 Sobic006G100000--Sobic010G209700 Sobic003G343600 Sobic003G343600 Sobic006G100000--Sobic003G343600 Sobic010G278600 Sobic010G278600 Sobic006G100000--Sobic010G278600 Sobic002G299100 Sobic002G299100 Sobic006G100000--Sobic002G299100 Sobic004G197900 Sobic004G197900 Sobic006G100000--Sobic004G197900 Sobic008G152900 Sobic008G152900 Sobic006G100000--Sobic008G152900 Sobic004G012000 Sobic004G012000 Sobic005G154700--Sobic004G012000 Sobic004G026100 Sobic004G026100 Sobic005G154700--Sobic004G026100 Sobic005G154700--Sobic004G197900 Sobic005G154700--Sobic009G040800 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic005G154700--Sobic005G015100 Sobic005G154700--Sobic005G127300 Sobic009G000400 Sobic009G000400 Sobic005G154700--Sobic009G000400 Sobic010G235600 Sobic010G235600 Sobic005G154700--Sobic010G235600 Sobic007G079200 Sobic007G079200 Sobic005G154700--Sobic007G079200 Sobic003G322200 Sobic003G322200 Sobic002G344500--Sobic003G322200 Sobic001G322600 Sobic001G322600 Sobic002G344500--Sobic001G322600 Sobic008G056900 Sobic008G056900 Sobic002G344500--Sobic008G056900 Sobic002G344500--Sobic009G096100 Sobic003G407600 Sobic003G407600 Sobic002G344500--Sobic003G407600 Sobic006G226300 Sobic006G226300 Sobic002G344500--Sobic006G226300 Sobic004G036700 Sobic004G036700 Sobic002G344500--Sobic004G036700 Sobic001G422500 Sobic001G422500 Sobic002G344500--Sobic001G422500 Sobic008G152300 Sobic008G152300 Sobic002G344500--Sobic008G152300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.