Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G128000.1
Synonym Sb05g018980
Functional annotation stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RJH6
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF645
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G50180 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g34920.1 : stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015734
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G011300.1 , HORVU2Hr1G011300.3 , HORVU2Hr1G011300.2 , HORVU2Hr1G011300.5 , HORVU2Hr1G011300.4 , HORVU2Hr1G011300.7 , HORVU2Hr1G011300.6 , HORVU2Hr1G011300.9 , HORVU2Hr1G011300.8 , HORVU2Hr1G011300.10
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G073300 - -
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12 Sobic.002G181450 - -
13 Sobic.010G073600 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@auxin response factor, putative, expressed -
14 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
15 Sobic.006G066000 - -
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17 Sobic.002G061400 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic005G128000--Sobic002G073300 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic005G128000--Sobic004G045566 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic005G128000--Sobic001G261537 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic005G128000--Sobic005G099150 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic005G128000--Sobic006G067100 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic005G128000--Sobic002G182300 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G237650 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic005G128000--Sobic010G139301 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic005G128000--Sobic008G106600 Sobic002G073300--Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic010G139301 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G073300--Sobic004G169501 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic002G182300 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic004G289500 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic002G181450 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G073300--Sobic007G142050 Sobic002G073300--Sobic004G045566 Sobic004G045566--Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G128000 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic002G073300 Sobic004G045566--Sobic002G182300 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic004G045566--Sobic006G072900 Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic004G045566--Sobic002G018100 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic004G045566--Sobic005G096800 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic004G045566--Sobic008G091671 Sobic001G261537--Sobic008G106600 Sobic001G261537--Sobic005G128000 Sobic001G261537--Sobic006G067100 Sobic001G261537--Sobic002G182300 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic001G261537--Sobic009G197200 Sobic001G261537--Sobic010G139301 Sobic001G078300 Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic008G091671 Sobic005G099150--Sobic004G045566 Sobic005G099150--Sobic006G068400 Sobic005G099150--Sobic010G139301 Sobic005G099150--Sobic005G128000 Sobic005G099150--Sobic002G182300 Sobic005G099150--Sobic002G073300 Sobic005G099150--Sobic008G091671 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic005G099150--Sobic007G089600 Sobic005G099150--Sobic007G142050 Sobic006G067100--Sobic005G128000 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic006G067100--Sobic006G066000 Sobic006G067100--Sobic001G261537 Sobic009G029500 Sobic009G029500 Sobic006G067100--Sobic009G029500 Sobic006G067100--Sobic008G106600 Sobic004G291700 Sobic004G291700 Sobic006G067100--Sobic004G291700 Sobic006G067100--Sobic005G099150 Sobic006G067100--Sobic008G091671 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic006G067100--Sobic003G159450 Sobic002G182300--Sobic004G169501 Sobic002G182300--Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic002G073300 Sobic002G182300--Sobic005G099150 Sobic002G182300--Sobic004G045566 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G181450 Sobic002G182300--Sobic007G142050 Sobic002G182300--Sobic006G068400 Sobic002G033600 Sobic002G033600 Sobic010G237650--Sobic002G033600 Sobic003G092066 Sobic003G092066 Sobic010G237650--Sobic003G092066 Sobic002G268900 Sobic002G268900 Sobic010G237650--Sobic002G268900 Sobic006G144000 Sobic006G144000 Sobic010G237650--Sobic006G144000 Sobic007G139400 Sobic007G139400 Sobic010G237650--Sobic007G139400 Sobic006G215100 Sobic006G215100 Sobic010G237650--Sobic006G215100 Sobic010G073600 Sobic010G073600 Sobic010G237650--Sobic010G073600 Sobic010G237650--Sobic005G128000 Sobic009G102000 Sobic009G102000 Sobic010G237650--Sobic009G102000 Sobic010G139301--Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic007G142050 Sobic010G139301--Sobic004G169501 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic002G073300 Sobic010G139301--Sobic002G182300 Sobic010G139301--Sobic005G099150 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic010G139301--Sobic008G068800 Sobic008G106600--Sobic001G261537 Sobic008G106600--Sobic006G068400 Sobic008G106600--Sobic008G091671 Sobic008G106600--Sobic005G128000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic009G197200 Sobic008G106600--Sobic010G139301 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G106600--Sobic009G067501 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic008G106600--Sobic004G289600
Octagon: transcription factors


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