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Transcriptome id Sobic.002G018100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q8Q2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G045566 - -
2 Sobic.001G265200 - -
3 Sobic.006G123900 chloroplastic group IIA intron splicing facilitator CRS1, chloroplast precursor, putative, expressed -
4 Sobic.005G077400 - -
5 Sobic.001G228700 - -
6 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
8 Sobic.006G039900 - -
9 Sobic.005G099150 - -
10 Sobic.002G061400 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G454301 - -
12 Sobic.002G076400 structural constituent of ribosome, putative, expressed -
13 Sobic.003G006833 - -
14 Sobic.008G106000 eukaryotic translation initiation factor 5B, putative, expressed K03243: translation initiation factor 5B
15 Sobic.006G063300 - -
16 Sobic.002G001600 MBTB12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.009G104300 - -
18 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
19 Sobic.008G091671 - -
20 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1


Gene co-expression network
sample Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic002G018100--Sobic004G045566 Sobic001G265200 Sobic001G265200 Sobic002G018100--Sobic001G265200 Sobic006G123900 Sobic006G123900 Sobic002G018100--Sobic006G123900 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic002G018100--Sobic005G077400 Sobic001G228700 Sobic001G228700 Sobic002G018100--Sobic001G228700 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic002G018100--Sobic002G330400 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G018100--Sobic005G128000 Sobic006G039900 Sobic006G039900 Sobic002G018100--Sobic006G039900 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic002G018100--Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G128000 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic006G068400 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic004G045566--Sobic002G073300 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic004G045566--Sobic002G182300 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic004G045566--Sobic006G072900 Sobic004G045566--Sobic002G018100 Sobic005G096800 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Sobic007G142050 Sobic005G099150--Sobic007G142050
Octagon: transcription factors


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