Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G265200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QL83
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G265200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G051450 - -
2 Sobic.002G018100 - -
3 Sobic.005G077400 - -
4 Sobic.006G262200 - -
5 Sobic.005G055150 - -
6 Sobic.008G068400 - -
7 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
10 Sobic.009G251300 endonuclease, putative, expressed -
11 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
12 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
13 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
14 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.006G191400 - -
16 Sobic.001G415750 - -
17 Sobic.007G054000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
18 Sobic.003G089650 - -
19 Sobic.008G136200 spotted leaf 11, putative, expressed -
20 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G265200 Sobic001G265200 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic001G265200--Sobic002G051450 Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic001G265200--Sobic002G018100 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic001G265200--Sobic005G077400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic001G265200--Sobic006G262200 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic001G265200--Sobic005G055150 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic001G265200--Sobic008G068400 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic001G265200--Sobic005G015100 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G265200--Sobic006G009400 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic001G265200--Sobic009G045700 Sobic002G051450--Sobic006G009400 Sobic002G051450--Sobic006G262200 Sobic002G051450--Sobic005G015100 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G051450--Sobic010G263800 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G051450--Sobic008G034600 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic002G051450--Sobic004G256600 Sobic002G051450--Sobic009G045700 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic002G051450--Sobic009G004700 Sobic002G051450--Sobic005G077400 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic002G018100--Sobic004G045566 Sobic002G018100--Sobic001G265200 Sobic006G123900 Sobic006G123900 Sobic002G018100--Sobic006G123900 Sobic002G018100--Sobic005G077400 Sobic001G228700 Sobic001G228700 Sobic002G018100--Sobic001G228700 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic002G018100--Sobic002G330400 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G018100--Sobic005G128000 Sobic006G039900 Sobic006G039900 Sobic002G018100--Sobic006G039900 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic002G018100--Sobic005G099150 Sobic005G077400--Sobic002G051450 Sobic005G077400--Sobic006G262200 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic005G077400--Sobic009G104300 Sobic005G077400--Sobic006G039900 Sobic005G077400--Sobic005G055150 Sobic003G020100 Sobic003G020100 Sobic005G077400--Sobic003G020100 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic005G077400--Sobic006G046000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G077400--Sobic001G267233 Sobic005G077400--Sobic009G045700 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic006G009400 Sobic005G055150--Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic005G110427 Sobic005G055150--Sobic001G111900 Sobic005G055150--Sobic006G262200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic005G055150--Sobic009G127900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic002G410200 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G055150--Sobic009G209800 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic005G055150--Sobic007G178700 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic008G068400--Sobic009G197200 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G068400--Sobic006G132200 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic008G068400--Sobic007G115000 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic008G068400--Sobic005G212500 Sobic008G068400--Sobic009G004700 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic008G068400--Sobic010G144100 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G068400--Sobic003G031750 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G068400--Sobic002G062300 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068400--Sobic003G424100 Sobic005G015100--Sobic002G051450 Sobic005G015100--Sobic008G034600 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic005G015100--Sobic002G158700 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G015100--Sobic001G464200 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G015100--Sobic006G128900 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic005G015100--Sobic006G145000 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic005G015100--Sobic002G421700 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic005G015100--Sobic004G271900 Sobic005G015100--Sobic004G256600 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic006G009400 Sobic009G045700--Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic010G263800 Sobic009G045700--Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic008G034600 Sobic009G045700--Sobic002G144966 Sobic008G153600 Sobic008G153600 Sobic009G045700--Sobic008G153600
Octagon: transcription factors


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