Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G330400.1
Synonym Sb02g035690
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5XAU3
Pfam -
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF314
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G18975 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g36180.2 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048343 , Zm00025a048321
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G043770.6 , HORVU2Hr1G043770.5 , HORVU2Hr1G043770.4 , HORVU2Hr1G043770.3 , HORVU2Hr1G043770.2 , HORVU2Hr1G043770.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G330400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.006G048775 - -
20 Sobic.003G057800 rho termination factor, N-terminal domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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