Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G048775.2,Sobic.006G048775.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RC84
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12340 : FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g12270.1 : peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046298
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G046000 - -
2 Sobic.001G479500 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K15891: NAD+-dependent farnesol dehydrogenase
3 Sobic.006G045901 - -
4 Sobic.003G057800 rho termination factor, N-terminal domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G180432 - -
6 Sobic.009G110366 - -
7 Sobic.002G212800 - -
8 Sobic.003G201750 - -
9 Sobic.005G130200 - -
10 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G497200 expressed protein -
12 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
14 Sobic.004G020401 - -
15 Sobic.009G198900 trehalose synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
16 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
17 Sobic.007G142050 - -
18 Sobic.005G187200 expressed protein -
19 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
20 Sobic.007G130100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic006G048775--Sobic006G046000 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic006G048775--Sobic001G479500 Sobic006G045901 Sobic006G045901 Sobic006G048775--Sobic006G045901 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic006G048775--Sobic003G057800 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic006G048775--Sobic006G180432 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic006G048775--Sobic009G110366 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic006G048775--Sobic002G212800 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic006G048775--Sobic003G201750 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic006G048775--Sobic005G130200 Sobic006G046000--Sobic006G048775 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G046000--Sobic008G079100 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic006G046000--Sobic001G272000 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic006G046000--Sobic009G104300 Sobic006G046000--Sobic001G479500 Sobic006G046000--Sobic006G045901 Sobic006G046000--Sobic003G057800 Sobic006G046000--Sobic002G212800 Sobic006G046000--Sobic009G110366 Sobic001G479500--Sobic003G057800 Sobic001G479500--Sobic005G130200 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G479500--Sobic010G248200 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic001G479500--Sobic008G161401 Sobic009G156000 Sobic009G156000 Sobic001G479500--Sobic009G156000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G479500--Sobic001G543900 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic001G479500--Sobic005G187200 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic001G479500--Sobic002G283300 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic001G479500--Sobic004G212800 Sobic006G045901--Sobic006G046000 Sobic006G045901--Sobic006G048775 Sobic006G045901--Sobic003G201750 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic006G045901--Sobic003G390400 Sobic003G006833 Sobic003G006833 Sobic006G045901--Sobic003G006833 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic006G045901--Sobic007G225800 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic006G045901--Sobic010G202000 Sobic003G383300 Sobic003G383300 Sobic006G045901--Sobic003G383300 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic006G045901--Sobic002G144933 Sobic003G057800--Sobic001G479500 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic003G057800--Sobic003G357500 Sobic003G057800--Sobic010G248200 Sobic003G057800--Sobic008G161401 Sobic003G057800--Sobic004G212800 Sobic003G057800--Sobic005G130200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G057800--Sobic007G073400 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic003G057800--Sobic004G016500 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G057800--Sobic001G046600 Sobic006G180432--Sobic003G057800 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic006G180432--Sobic001G269300 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic006G180432--Sobic007G052900 Sobic006G180432--Sobic001G479500 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic006G180432--Sobic001G497200 Sobic006G180432--Sobic001G046600 Sobic006G180432--Sobic005G187200 Sobic006G180432--Sobic004G016500 Sobic006G180432--Sobic006G048775 Sobic009G110366--Sobic007G073400 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic004G020401 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic009G110366--Sobic009G109450 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic003G258400 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G110366--Sobic006G196000 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G143700 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G110366--Sobic004G291800 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G110366--Sobic009G180200 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic009G110366--Sobic009G198900 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic002G212800--Sobic007G112900 Sobic002G212800--Sobic004G291800 Sobic002G212800--Sobic006G046000 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic002G212800--Sobic003G159450 Sobic002G212800--Sobic006G048775 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic002G212800--Sobic009G197200 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic002G212800--Sobic008G091671 Sobic002G212800--Sobic009G110366 Sobic002G212800--Sobic004G020401 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic003G201750--Sobic005G001900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic003G201750--Sobic006G088580 Sobic003G201750--Sobic001G269300 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic003G201750--Sobic002G330400 Sobic003G201750--Sobic006G048775 Sobic006G137400 Sobic006G137400 Sobic003G201750--Sobic006G137400 Sobic003G201750--Sobic003G006833 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G201750--Sobic007G037900 Sobic007G037100 Sobic007G037100 Sobic003G201750--Sobic007G037100 Sobic005G130200--Sobic010G248200 Sobic005G130200--Sobic001G479500 Sobic005G130200--Sobic001G543900 Sobic005G130200--Sobic008G161401 Sobic005G130200--Sobic009G156000 Sobic005G130200--Sobic002G283300 Sobic005G130200--Sobic004G212800 Sobic005G130200--Sobic003G057800 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic005G130200--Sobic001G477800
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