Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G006833.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5XJM9
Pfam PF00013 PF10469
Panther DB PTHR13360 PTHR13360:SF1
NCBI CDD KOG2814; Transcription coactivator complex, P50 component (LigT RNA ligase/phosphodiesterase family)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003723; RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G16230 : Predicted eukaryotic LigT
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g13100.1 : KH domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009509 , Zm00025a022817 , Zm00025a022819
Brachypodium KQK03427
Barley HORVU5Hr1G066640.1 , HORVU5Hr1G066640.2 , HORVU2Hr1G113270.1 , HORVU2Hr1G113270.4 , HORVU2Hr1G113270.5 , HORVU2Hr1G113270.7 , HORVU2Hr1G113270.8 , HORVU5Hr1G066660.1 , HORVU4Hr1G027750.1 , HORVU4Hr1G027750.3 , HORVU4Hr1G027750.2 , HORVU2Hr1G113260.1
Wheat TraesCS2A02G510800 , TraesCS2A02G510800 , TraesCS2A02G510700 , TraesCS3A02G434500 , TraesCS2B02G538600 , TraesCS2D02G511800 , TraesCS2D02G512000 , TraesCS2D02G578300 , TraesCS3A02G155600 , TraesCS3A02G155600 , TraesCS2D02G512100 , TraesCS2A02G510400 , TraesCS2A02G567700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
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Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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