Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G072900.1
Synonym
Functional annotation hydrolase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PKR7
Pfam -
Panther DB PTHR10992 PTHR10992:SF779
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78210 : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g42994.1 : hydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G072900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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7 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
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16 Sobic.005G195800 RNA recognition motif containing protein, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
17 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
18 Sobic.003G173950 - -
19 Sobic.007G112900 - -
20 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3


Gene co-expression network
sample Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic003G006833 Sobic003G006833 Sobic006G072900--Sobic003G006833 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic006G072900--Sobic009G104300 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic006G072900--Sobic002G073300 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic006G072900--Sobic004G045566 Sobic001G172200 Sobic001G172200 Sobic006G072900--Sobic001G172200 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic006G072900--Sobic001G454301 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic006G072900--Sobic007G089600 Sobic002G335700 Sobic002G335700 Sobic006G072900--Sobic002G335700 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic006G072900--Sobic002G181450 Sobic003G006833--Sobic007G089600 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic003G006833--Sobic003G201750 Sobic003G006833--Sobic006G072900 Sobic003G006833--Sobic002G181450 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic003G006833--Sobic003G315332 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic003G006833--Sobic002G076400 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic003G006833--Sobic007G142050 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic003G006833--Sobic003G204000 Sobic006G045901 Sobic006G045901 Sobic003G006833--Sobic006G045901 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic009G104300--Sobic007G116400 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic009G104300--Sobic006G080300 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G104300--Sobic003G170100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic009G104300--Sobic001G094000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic009G104300--Sobic001G543900 Sobic009G104300--Sobic001G454301 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic009G104300--Sobic007G137900 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic009G104300--Sobic001G272000 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic009G104300--Sobic001G477800 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic005G128000 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G073300--Sobic010G139301 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G073300--Sobic004G169501 Sobic002G073300--Sobic001G454301 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G073300--Sobic002G182300 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic007G142050 Sobic002G073300--Sobic004G045566 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G128000 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic002G073300 Sobic004G045566--Sobic002G182300 Sobic004G045566--Sobic006G072900 Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic004G045566--Sobic002G018100 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic004G045566--Sobic005G096800 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic004G045566--Sobic008G091671 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic001G172200--Sobic006G013500 Sobic003G173950 Sobic003G173950 Sobic001G172200--Sobic003G173950 Sobic001G172200--Sobic006G080300 Sobic010G152850 Sobic010G152850 Sobic001G172200--Sobic010G152850 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G172200--Sobic001G306900 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic001G172200--Sobic009G086900 Sobic001G172200--Sobic003G170100 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G172200--Sobic001G303675 Sobic001G172200--Sobic006G072900 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic007G089600--Sobic007G142050 Sobic007G089600--Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic004G169501 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G089600--Sobic008G068800 Sobic007G089600--Sobic003G315332 Sobic007G089600--Sobic009G104300 Sobic007G089600--Sobic001G272000 SobicK009900 SobicK009900 Sobic007G089600--SobicK009900 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G089600--Sobic005G001900 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic002G335700--Sobic008G116500 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G335700--Sobic002G061400 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic002G335700--Sobic007G011400 Sobic002G335700--Sobic001G094000 Sobic007G188900 Sobic007G188900 Sobic002G335700--Sobic007G188900 Sobic002G335700--Sobic009G104300 Sobic002G335700--Sobic008G117200 Sobic002G335700--Sobic003G315332 Sobic002G335700--Sobic004G169501 Sobic002G181450--Sobic004G169501 Sobic002G181450--Sobic007G142050 Sobic002G181450--Sobic005G001900 Sobic002G181450--Sobic003G315332 Sobic002G181450--Sobic007G089600 Sobic002G181450--Sobic003G204000 Sobic002G181450--Sobic002G073300 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G181450--Sobic002G124200 Sobic002G181450--Sobic002G076400
Octagon: transcription factors


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