Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G190300.1,Sobic.003G190300.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q4A4 , A0A1B6Q490
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.003G190300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G205501 - -
2 Sobic.005G040900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10601: SYVN1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin
3 Sobic.001G296500 ARABIDILLO-1, putative, expressed -
4 Sobic.006G072900 hydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.003G205801 - -
6 Sobic.002G115500 PHD finger protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G045566 - -
8 Sobic.008G127400 OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G267900 - -
10 Sobic.009G074700 heat shock protein binding protein, putative, expressed K09540: SEC63, translocation protein SEC63
11 Sobic.008G058800 OsFBX369 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G096800 - -
13 Sobic.010G245000 DTW domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G267300 expressed protein -
15 Sobic.006G028250 - -
16 Sobic.006G165000 RNA recognition motif containing protein, expressed -
17 Sobic.006G048300 - -
18 Sobic.006G180700 SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed K14439: SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1
19 Sobic.001G085700 STE_PAK_Ste20_KHSh_GCKh_HPKh.1 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
20 Sobic.003G185200 chaperone protein dnaJ 49, putative, expressed K09518: DnaJ homolog subfamily B member 12


Gene co-expression network
sample Sobic003G190300 Sobic003G190300 Sobic003G205501 Sobic003G205501 Sobic003G190300--Sobic003G205501 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic003G190300--Sobic005G040900 Sobic001G296500 Sobic001G296500 Sobic003G190300--Sobic001G296500 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic003G190300--Sobic006G072900 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic003G190300--Sobic003G205801 Sobic002G115500 Sobic002G115500 Sobic003G190300--Sobic002G115500 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic003G190300--Sobic004G045566 Sobic008G127400 Sobic008G127400 Sobic003G190300--Sobic008G127400 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic003G190300--Sobic001G267900 Sobic001G408700 Sobic001G408700 Sobic003G205501--Sobic001G408700 Sobic006G128800 Sobic006G128800 Sobic003G205501--Sobic006G128800 Sobic004G345700 Sobic004G345700 Sobic003G205501--Sobic004G345700 Sobic006G267300 Sobic006G267300 Sobic003G205501--Sobic006G267300 Sobic010G202600 Sobic010G202600 Sobic003G205501--Sobic010G202600 Sobic010G245000 Sobic010G245000 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Octagon: transcription factors


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