Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G063300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKK9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.006G063300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G112500 - -
2 Sobic.007G142050 - -
3 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
5 Sobic.001G272000 - -
6 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G346600 transporter family protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G204000 expressed protein -
9 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
10 Sobic.007G116400 - -
11 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
12 Sobic.009G104300 - -
13 Sobic.004G286900 - -
14 Sobic.002G073300 - -
15 Sobic.003G015000 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
16 Sobic.005G099150 - -
17 Sobic.001G271801 - -
18 Sobic.006G046000 - -
19 Sobic.004G193800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K14759: isochorismate synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase / 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase / O-succinylbenzoate synthase
20 Sobic.005G077400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G063300 Sobic006G063300 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic006G063300--Sobic004G112500 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic006G063300--Sobic007G142050 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic006G063300--Sobic001G024200 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic006G063300--Sobic007G089600 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic006G063300--Sobic001G272000 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic006G063300--Sobic008G068800 Sobic002G346600 Sobic002G346600 Sobic006G063300--Sobic002G346600 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic006G063300--Sobic003G204000 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic006G063300--Sobic009G059600 Sobic004G112500--Sobic001G024200 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic004G112500--Sobic004G212800 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic004G112500--Sobic007G211000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic004G112500--Sobic001G543900 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic004G112500--Sobic004G164600 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic004G112500--Sobic010G248200 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic004G112500--Sobic010G124001 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G112500--Sobic008G157950 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic004G112500--Sobic008G042250 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic001G024200--Sobic004G212800 Sobic001G024200--Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic004G112500 Sobic001G024200--Sobic003G204000 Sobic001G024200--Sobic001G272000 Sobic001G024200--Sobic004G164600 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G024200--SobicK009900 Sobic001G439500 Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic010G248200 Sobic007G089600--Sobic007G142050 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic004G169501 Sobic007G089600--Sobic008G068800 Sobic007G089600--Sobic003G315332 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G089600--Sobic009G104300 Sobic007G089600--Sobic001G272000 Sobic007G089600--SobicK009900 Sobic007G089600--Sobic005G001900 Sobic001G271900 Sobic001G271900 Sobic001G272000--Sobic001G271900 Sobic001G272000--SobicK009900 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic001G272000--Sobic001G287301 Sobic001G272000--Sobic001G024200 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G272000--Sobic008G049701 Sobic001G272000--Sobic001G543900 Sobic001G272000--Sobic008G042250 Sobic001G272000--Sobic007G211000 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G272000--Sobic005G110430 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic002G346600--Sobic006G063300 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic002G346600--Sobic007G225800 Sobic002G346600--Sobic003G315332 Sobic002G186000 Sobic002G186000 Sobic002G346600--Sobic002G186000 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic002G346600--Sobic002G076400 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic002G346600--Sobic005G212500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic002G346600--Sobic004G016500 Sobic002G346600--Sobic007G142050 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic002G346600--Sobic001G046600 Sobic003G204000--Sobic001G024200 Sobic003G204000--Sobic008G068800 Sobic003G204000--Sobic004G212800 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic003G204000--Sobic008G116500 Sobic003G204000--Sobic004G169501 Sobic003G204000--Sobic001G543900 Sobic003G204000--Sobic004G112500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic003G204000--Sobic002G297800 Sobic003G204000--Sobic003G315332 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic004G076732
Octagon: transcription factors


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