Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G105300.4,Sobic.008G105300.6,Sobic.008G105300.2,Sobic.008G105300.3
Synonym Sb08g015916
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R5X3 , A0A1B6PDA0 , A0A1B6PD05
Pfam PF13365
Panther DB PTHR18868 PTHR18868:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g62910.3,LOC_Os03g01940.1,LOC_Os01g56870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK22064 , KQK04034 , KQK04035 , KQK21986
Barley -
Wheat TraesCS6B02G240200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G143400 - -
2 Sobic.008G110800 - -
3 Sobic.008G105850 - -
4 Sobic.009G001800 expressed protein -
5 Sobic.009G029500 cation efflux family protein, putative, expressed K14689: SLC30A2, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2
6 Sobic.006G067100 ribosome inactivating protein, putative, expressed -
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8 Sobic.008G117800 OsGrx_C12 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
9 Sobic.001G201966 - -
10 Sobic.003G118800 - -
11 Sobic.001G236800 tRNA methyltransferase, putative, expressed K00927: PGK, phosphoglycerate kinase
12 Sobic.007G210600 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G084000 expressed protein -
14 Sobic.005G031500 - -
15 Sobic.010G253901 - -
16 Sobic.006G066000 - -
17 Sobic.007G201400 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.008G008500 protein phosphatase 2c, putative, expressed -
19 Sobic.001G495300 expressed protein -
20 Sobic.008G106600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic008G105300--Sobic004G143400 Sobic008G110800 Sobic008G110800 Sobic008G105300--Sobic008G110800 Sobic008G105850 Sobic008G105850 Sobic008G105300--Sobic008G105850 Sobic009G001800 Sobic009G001800 Sobic008G105300--Sobic009G001800 Sobic009G029500 Sobic009G029500 Sobic008G105300--Sobic009G029500 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic008G105300--Sobic006G067100 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic008G105300--Sobic001G261537 Sobic008G117800 Sobic008G117800 Sobic008G105300--Sobic008G117800 Sobic001G201966 Sobic001G201966 Sobic008G105300--Sobic001G201966 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic004G143400--Sobic005G084000 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic004G143400--Sobic001G269300 Sobic007G210600 Sobic007G210600 Sobic004G143400--Sobic007G210600 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic004G143400--Sobic001G495300 Sobic004G151900 Sobic004G151900 Sobic004G143400--Sobic004G151900 Sobic006G060200 Sobic006G060200 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Octagon: transcription factors


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