Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G084000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PR00
Pfam PF13962 PF12796
Panther DB PTHR24177 PTHR24177:SF38
NCBI CDD KOG0502; Integral membrane ankyrin-repeat protein Kidins220 (protein kinase D substrate) KOG441226S proteasome regulatory complex, subunit PSMD10
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G03670 : ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g14520.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G598600 , TraesCS3B02G598800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G495300 expressed protein -
2 Sobic.007G210600 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
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10 Sobic.003G305300 - -
11 Sobic.006G060200 basic proline-rich protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G384800 expressed protein -
13 Sobic.006G248200 - -
14 Sobic.003G071600 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, putative, expressed K10258: TER, TSC13, very-long-chain enoyl-CoA reductase
15 Sobic.008G008500 protein phosphatase 2c, putative, expressed -
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18 Sobic.006G263800 HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3, putative, expressed -
19 Sobic.008G104801 - -
20 Sobic.002G190100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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