Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G001800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P5T1
Pfam PF11820
Panther DB PTHR33128
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G08391 : Protein of unknown function (DUF 3339)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g01290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G105300 expressed protein -
2 Sobic.004G296500 serine esterase family protein, putative, expressed -
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15 Sobic.001G384800 expressed protein -
16 Sobic.003G069100 regulator of ribonuclease, putative, expressed -
17 Sobic.003G074700 thylakoid lumenal protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G445100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13195: cold-inducible RNA-binding protein
19 Sobic.008G088000 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G071600 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, putative, expressed K10258: TER, TSC13, very-long-chain enoyl-CoA reductase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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