Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G069700.2
Synonym Sb03g005903
Functional annotation receptor kinase, putative, expressed
UniProt C5XPX4
Pfam PF08263 PF00560 PF13855 PF00069
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF50
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05960.1 : receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035651
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6D02G000900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G201400 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G069700 Sobic003G069700 Sobic009G001800 Sobic009G001800 Sobic003G069700--Sobic009G001800 Sobic008G060150 Sobic008G060150 Sobic003G069700--Sobic008G060150 Sobic004G170600 Sobic004G170600 Sobic003G069700--Sobic004G170600 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic003G069700--Sobic005G084000 Sobic007G201650 Sobic007G201650 Sobic003G069700--Sobic007G201650 Sobic010G107400 Sobic010G107400 Sobic003G069700--Sobic010G107400 Sobic008G151000 Sobic008G151000 Sobic003G069700--Sobic008G151000 Sobic008G105850 Sobic008G105850 Sobic003G069700--Sobic008G105850 Sobic009G083300 Sobic009G083300 Sobic003G069700--Sobic009G083300 Sobic008G105300 Sobic008G105300 Sobic009G001800--Sobic008G105300 Sobic004G296500 Sobic004G296500 Sobic009G001800--Sobic004G296500 Sobic003G118800 Sobic003G118800 Sobic009G001800--Sobic003G118800 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic009G001800--Sobic004G143400 Sobic009G001800--Sobic003G069700 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic009G001800--Sobic001G495300 Sobic007G210600 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Octagon: transcription factors


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