Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G276133.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RPR0
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF20
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g51010.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G159300 expressed protein -
2 Sobic.001G423633 - -
3 Sobic.001G450300 PPR repeat containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G292932 - -
5 Sobic.001G252600 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G268000 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit P, putative, expressed K03861: PIGP, GPI19, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit P
7 Sobic.003G236100 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.005G208425 - -
9 Sobic.001G152360 - -
10 Sobic.010G116800 DNA topoisomerase I family protein, expressed -
11 Sobic.003G420000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G241500 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
13 Sobic.004G144200 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
14 Sobic.001G523100 - -
15 Sobic.006G241000 homeobox domain containing protein, expressed -
16 Sobic.008G088812 - -
17 Sobic.009G251600 cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial precursor, putative, expressed K02265: cytochrome c oxidase subunit 5b
18 Sobic.004G005900 expressed protein -
19 Sobic.004G347700 OsFBX250 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G059800 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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