Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G423633.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SA80
Pfam -
Panther DB PTHR24286 PTHR24286:SF67
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05160 : cytochrome P450, family 88, subfamily A, polypeptide 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g02019.1 : cytochrome P450, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052773 , Zm00025a050284
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS4A02G460100 , TraesCS7A02G029600 , TraesCS7D02G026000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G119100 - -
2 Sobic.002G076450 - -
3 Sobic.009G037600 RNA methyltransferase, TrmH family protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G015950 - -
5 Sobic.010G051900 expressed protein -
6 Sobic.003G092150 - -
7 Sobic.006G049000 - -
8 Sobic.006G241000 homeobox domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G331200 - -
10 Sobic.009G193600 Eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G201100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
12 Sobic.001G367900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@annexin, putative, expressed -
13 Sobic.005G040950 - -
14 Sobic.001G524900 ribosomal protein L5, putative, expressed K02931: RP-L5, MRPL5, large subunit ribosomal protein L5
15 Sobic.005G208425 - -
16 Sobic.004G071850 - -
17 Sobic.009G043900 O-methyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.003G289300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G241500 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
20 Sobic.003G260050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G423633 Sobic001G423633 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic001G423633--Sobic008G119100 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic001G423633--Sobic002G076450 Sobic009G037600 Sobic009G037600 Sobic001G423633--Sobic009G037600 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic001G423633--Sobic002G015950 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic001G423633--Sobic010G051900 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic001G423633--Sobic003G092150 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic001G423633--Sobic006G049000 Sobic006G241000 Sobic006G241000 Sobic001G423633--Sobic006G241000 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic001G423633--Sobic003G331200 Sobic008G119100--Sobic002G076450 Sobic008G119100--Sobic010G051900 Sobic001G524900 Sobic001G524900 Sobic008G119100--Sobic001G524900 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic008G119100--Sobic001G367900 Sobic008G119100--Sobic003G331200 Sobic008G119100--Sobic003G092150 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic008G119100--Sobic005G040950 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic008G119100--Sobic009G047033 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic008G119100--Sobic007G226000 Sobic002G076450--Sobic008G119100 Sobic002G076450--Sobic010G051900 Sobic002G076450--Sobic009G047033 Sobic005G201100 Sobic005G201100 Sobic002G076450--Sobic005G201100 Sobic002G076450--Sobic001G524900 Sobic002G076450--Sobic005G040950 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic002G076450--Sobic006G128450 Sobic002G076450--Sobic003G092150 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic002G076450--Sobic003G289300 Sobic009G037600--Sobic002G076450 Sobic009G037600--Sobic005G040950 Sobic009G037600--Sobic010G051900 Sobic009G037600--Sobic003G289300 Sobic009G037600--Sobic008G119100 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic009G037600--Sobic001G241500 Sobic010G051600 Sobic010G051600 Sobic009G037600--Sobic010G051600 Sobic009G037600--Sobic009G047033 Sobic009G037600--Sobic001G423633 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic002G015950--Sobic009G043900 Sobic010G051900--Sobic005G040950 Sobic010G051900--Sobic008G119100 Sobic010G051900--Sobic002G076450 Sobic010G051900--Sobic009G047033 Sobic010G051900--Sobic010G051600 Sobic010G051900--Sobic003G289300 Sobic010G051900--Sobic001G241500 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic010G051900--Sobic003G157800 Sobic010G051900--Sobic001G524900 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic003G092150--Sobic008G065700 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic003G092150--Sobic007G210200 Sobic003G092150--Sobic001G367900 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic003G092150--Sobic003G149400 Sobic003G092150--Sobic008G119100 Sobic003G092150--Sobic009G047033 Sobic003G092150--Sobic007G226000 Sobic003G092150--Sobic002G076450 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic003G092150--Sobic005G110553 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic006G049000--Sobic001G273950 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic006G049000--Sobic002G215600 Sobic006G049000--Sobic002G015950 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic006G049000--Sobic001G071500 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic006G049000--Sobic008G030801 Sobic001G442750 Sobic001G442750 Sobic006G049000--Sobic001G442750 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic006G049000--Sobic006G161200 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic006G049000--Sobic004G167500 Sobic006G049000--Sobic009G193600 Sobic006G241000--Sobic009G043900 Sobic006G241000--Sobic002G015950 Sobic006G241000--Sobic003G260050 Sobic006G241000--Sobic009G193600 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic006G241000--Sobic003G019500 Sobic006G241000--Sobic004G071850 Sobic006G241000--Sobic003G111700 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic006G241000--Sobic008G088812 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic006G241000--Sobic006G037500 Sobic004G000500 Sobic004G000500 Sobic003G331200--Sobic004G000500 Sobic003G331200--Sobic001G367900 Sobic003G331200--Sobic008G119100 Sobic003G331200--Sobic007G210200 Sobic003G331200--Sobic003G092150 Sobic003G331200--Sobic009G193600 Sobic002G347750 Sobic002G347750 Sobic003G331200--Sobic002G347750 Sobic003G331200--Sobic008G065700 Sobic003G331200--Sobic007G226000
Octagon: transcription factors


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