Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G241000.1
Synonym WOX4, Sb06g030700
Functional annotation homeobox domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RFT4
Pfam PF00046
Panther DB PTHR24326 PTHR24326:SF263
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G46480 : WUSCHEL related homeobox 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g55590.1 : homeobox domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040785 , Zm00025a009417 , Zm00025a012986 , Zm00025a057205 , Zm00025a033532 , Zm00025a026819 , Zm00025a039612 , Zm00025a026917
Brachypodium KQJ85141 , KQJ84981 , KQJ92701 , KQK10633 , KQK07789
Barley HORVU1Hr1G010580.3 , HORVU1Hr1G010580.2 , HORVU1Hr1G010580.1 , HORVU3Hr1G085050.1 , HORVU3Hr1G085050.3 , HORVU3Hr1G085050.4 , HORVU2Hr1G113820.6 , HORVU3Hr1G086450.1 , HORVU5Hr1G049190.2 , HORVU5Hr1G049190.3 , HORVU5Hr1G049190.1 , HORVU5Hr1G022120.1 , HORVU2Hr1G113820.5 , HORVU2Hr1G113820.8 , HORVU2Hr1G113820.7 , HORVU2Hr1G113820.1 , HORVU2Hr1G113820.3 , HORVU2Hr1G113820.2 , HORVU2Hr1G113820.4
Wheat TraesCS5D02G097400 , TraesCS3D02G352500 , TraesCS1B02G069000 , TraesCS3B02G399800 , TraesCS2D02G515600 , TraesCS2A02G514000 , TraesCS1D02G054000 , TraesCS5A02G085000 , TraesCS3D02G361100 , TraesCS3B02G391100 , TraesCS2B02G542600 , TraesCS5D02G162600 , TraesCS3A02G368100 , TraesCS3A02G358200 , TraesCS5B02G156400 , TraesCS1A02G052000 , TraesCS3D02G352600 , TraesCS2A02G491900 , TraesCS5A02G157300 , TraesCS5B02G091000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G043900 O-methyltransferase, putative, expressed -
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18 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
19 Sobic.002G202050 - -
20 Sobic.002G202050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G241000 Sobic006G241000 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic006G241000--Sobic009G043900 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic006G241000--Sobic002G015950 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic006G241000--Sobic003G260050 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic006G241000--Sobic009G193600 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic006G241000--Sobic003G019500 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic006G241000--Sobic004G071850 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic006G241000--Sobic003G111700 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic006G241000--Sobic008G088812 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic006G241000--Sobic006G037500 Sobic009G043900--Sobic003G019500 Sobic009G043900--Sobic003G260050 Sobic009G043900--Sobic003G111700 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic009G043900--Sobic010G194801 Sobic009G043900--Sobic004G071850 Sobic009G043900--Sobic002G015950 Sobic009G043900--Sobic008G088812 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic009G043900--Sobic002G202050 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic009G043900 Sobic003G260050--Sobic003G111700 Sobic003G260050--Sobic010G194801 Sobic003G260050--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic002G015950 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G260050--Sobic003G281000 Sobic009G193600--Sobic002G015950 Sobic009G193600--Sobic006G037500 Sobic009G193600--Sobic004G071850 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic009G193600--Sobic005G205100 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic009G193600--Sobic001G273950 Sobic009G193600--Sobic003G260050 Sobic009G193600--Sobic003G111700 Sobic009G193600--Sobic009G043900 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic009G193600--Sobic006G049000 Sobic003G019500--Sobic010G194801 Sobic003G019500--Sobic003G111700 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic003G019500--Sobic005G156201 Sobic003G019500--Sobic008G088812 Sobic003G019500--Sobic003G260050 Sobic003G019500--Sobic009G043900 Sobic003G019500--Sobic002G202050 Sobic004G071850--Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G111700 Sobic004G071850--Sobic010G194801 Sobic004G071850--Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic002G015950 Sobic004G071850--Sobic009G043900 Sobic004G071850--Sobic006G037500 Sobic004G071850--Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic002G202050 Sobic003G111700--Sobic003G260050 Sobic003G111700--Sobic010G194801 Sobic003G111700--Sobic002G202050 Sobic003G111700--Sobic006G247200 Sobic003G111700--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G111700--Sobic010G143666 Sobic008G088812--Sobic010G194801 Sobic008G088812--Sobic003G019500 Sobic008G088812--Sobic005G156201 Sobic008G088812--Sobic003G111700 Sobic008G088812--Sobic003G260050 Sobic008G088812--Sobic001G310000 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic008G088812--Sobic005G208425 Sobic008G088812--Sobic009G043900 Sobic008G088812--Sobic002G015950 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic006G037500--Sobic009G043800 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic006G037500--Sobic002G191450 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic006G037500--Sobic001G064400 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic006G037500--Sobic002G114200 Sobic006G037500--Sobic004G071850 Sobic006G037500--Sobic009G193600 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic006G037500--Sobic009G019400 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic006G037500--Sobic004G221800 Sobic006G037500--Sobic003G260050
Octagon: transcription factors


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