Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G016600.1
Synonym ILR1, Sb08g001450
Functional annotation hydrolase, putative, expressed
UniProt C5YQM6
Pfam PF07687 PF01546
Panther DB PTHR11014 PTHR11014:SF113
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14664; IAA-amino acid hydrolase
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity GO:0008152metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G02875 : Peptidase M20/M25/M40 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g14590.1 : hydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019501 , Zm00025a045526 , Zm00025a027843
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G055060.2 , HORVU5Hr1G055060.7 , HORVU5Hr1G055060.6 , HORVU5Hr1G055060.9 , HORVU5Hr1G055060.8
Wheat TraesCS5B02G178100 , TraesCS5D02G184700 , TraesCS5A02G180200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
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16 Sobic.002G202050 - -
17 Sobic.002G202050 - -
18 Sobic.002G202050 - -
19 Sobic.002G202050 - -
20 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G016600 Sobic008G016600 Sobic009G172100 Sobic009G172100 Sobic008G016600--Sobic009G172100 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic008G016600--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic008G016600--Sobic003G111700 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic008G016600--Sobic005G156201 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic008G016600--Sobic010G194801 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic008G016600--Sobic004G071850 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic008G016600--Sobic003G019500 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic008G016600--Sobic002G015950 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic008G016600--Sobic001G310000 Sobic009G172100--Sobic005G156201 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic009G172100--Sobic008G088812 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic009G172100--Sobic009G018100 Sobic009G172100--Sobic010G194801 Sobic009G172100--Sobic003G019500 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic009G172100--Sobic005G208425 Sobic009G172100--Sobic003G111700 Sobic009G172100--Sobic001G310000 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic009G172100--Sobic005G205100 Sobic003G260050--Sobic003G111700 Sobic003G260050--Sobic010G194801 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic003G260050--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic002G015950 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G260050--Sobic003G281000 Sobic003G111700--Sobic003G260050 Sobic003G111700--Sobic010G194801 Sobic003G111700--Sobic002G202050 Sobic003G111700--Sobic006G247200 Sobic003G111700--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G111700--Sobic010G143666 Sobic005G156201--Sobic003G019500 Sobic005G156201--Sobic009G018100 Sobic005G156201--Sobic008G088812 Sobic005G156201--Sobic010G194801 Sobic005G156201--Sobic009G172100 Sobic005G156201--Sobic003G111700 Sobic005G156201--Sobic001G310000 Sobic005G156201--Sobic005G208425 Sobic005G156201--Sobic005G205100 Sobic010G194801--Sobic003G111700 Sobic010G194801--Sobic003G019500 Sobic010G194801--Sobic003G260050 Sobic010G194801--Sobic008G088812 Sobic010G194801--Sobic002G202050 Sobic010G194801--Sobic006G247200 Sobic004G071850--Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G111700 Sobic004G071850--Sobic010G194801 Sobic004G071850--Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic002G015950 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic004G071850--Sobic009G043900 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic004G071850--Sobic006G037500 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic002G202050 Sobic003G019500--Sobic010G194801 Sobic003G019500--Sobic003G111700 Sobic003G019500--Sobic005G156201 Sobic003G019500--Sobic008G088812 Sobic003G019500--Sobic003G260050 Sobic003G019500--Sobic009G043900 Sobic003G019500--Sobic002G202050 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic009G043900 Sobic001G310000--Sobic010G011500 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic001G310000--Sobic004G296750 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G310000--Sobic006G049633 Sobic001G310000--Sobic003G111700 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic001G310000--Sobic002G055000 Sobic001G310000--Sobic002G266700 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic001G310000--Sobic001G480900 Sobic001G310000--Sobic003G281000 Sobic001G310000--Sobic010G194801
Octagon: transcription factors


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