Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G068750.1,Sobic.003G068750.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109ND97 , A0A1W0VW20 , A0A1W0VW01
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G064700 expressed protein -
2 Sobic.010G041400 6-phosphofructokinase, putative, expressed K00850: pfkA, 6-phosphofructokinase 1
3 Sobic.009G156100 - -
4 Sobic.001G376100 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@OsFBX72 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G216700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
6 Sobic.005G207400 - -
7 Sobic.006G155100 expressed protein -
8 Sobic.003G039900 OsFBDUF1 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G005700 expressed protein -
10 Sobic.009G126600 cyclin-dependent kinase D-1, putative, expressed K02202: cyclin-dependent kinase 7
11 Sobic.007G010000 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
12 Sobic.004G111600 - -
13 Sobic.003G377500 OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G166000 ESP1, putative, expressed -
15 Sobic.002G016200 STE_MEKK_ste11_MAP3K.20 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
16 Sobic.006G215900 OsFBX172 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G098200 peroxidase family protein, expressed -
18 Sobic.001G092300 PPR repeat containing protein, expressed -
19 Sobic.004G068100 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
20 Sobic.003G242700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G068750 Sobic003G068750 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic003G068750--Sobic005G064700 Sobic010G041400 Sobic010G041400 Sobic003G068750--Sobic010G041400 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic003G068750--Sobic009G156100 Sobic001G376100 Sobic001G376100 Sobic003G068750--Sobic001G376100 Sobic007G216700 Sobic007G216700 Sobic003G068750--Sobic007G216700 Sobic005G207400 Sobic005G207400 Sobic003G068750--Sobic005G207400 Sobic006G155100 Sobic006G155100 Sobic003G068750--Sobic006G155100 Sobic003G039900 Sobic003G039900 Sobic003G068750--Sobic003G039900 Sobic010G005700 Sobic010G005700 Sobic003G068750--Sobic010G005700 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic005G064700--Sobic008G106600 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic005G064700--Sobic001G261537 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic005G064700--Sobic006G028700 Sobic005G064700--Sobic003G068750 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic005G064700--Sobic004G089500 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic005G064700--Sobic009G228400 Sobic009G000400 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Octagon: transcription factors


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