Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G377500.2
Synonym Sb03g041730
Functional annotation OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5XRF0
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G15710 : Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g33490.1 : OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039500
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G377500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.003G242700 - -
20 Sobic.003G302300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G377500 Sobic003G377500 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic003G377500--Sobic009G156100 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic003G377500--Sobic001G114200 Sobic006G005200 Sobic006G005200 Sobic003G377500--Sobic006G005200 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic003G377500--Sobic008G116700 Sobic003G405600 Sobic003G405600 Sobic003G377500--Sobic003G405600 Sobic002G200000 Sobic002G200000 Sobic003G377500--Sobic002G200000 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic003G377500--Sobic003G402800 Sobic005G090200 Sobic005G090200 Sobic003G377500--Sobic005G090200 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic003G377500--Sobic008G055500 Sobic009G156100--Sobic003G377500 Sobic004G068100 Sobic004G068100 Sobic009G156100--Sobic004G068100 Sobic009G156100--Sobic001G114200 Sobic009G156100--Sobic008G116700 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic009G156100--Sobic006G060000 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic009G156100--Sobic007G076400 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic009G156100--Sobic003G181700 Sobic009G156100--Sobic006G005200 Sobic009G156100--Sobic002G200000 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic001G114200--Sobic004G350700 Sobic001G114200--Sobic006G060000 Sobic010G160300 Sobic010G160300 Sobic001G114200--Sobic010G160300 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic001G114200--Sobic003G117800 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic001G114200--Sobic003G394500 Sobic006G210700 Sobic006G210700 Sobic001G114200--Sobic006G210700 Sobic001G490900 Sobic001G490900 Sobic001G114200--Sobic001G490900 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic001G114200--Sobic007G030100 Sobic007G218600 Sobic007G218600 Sobic001G114200--Sobic007G218600 Sobic006G005200--Sobic006G060000 Sobic006G005200--Sobic009G156100 Sobic006G005200--Sobic003G377500 Sobic006G005200--Sobic001G114200 Sobic006G005200--Sobic008G055500 Sobic006G005200--Sobic002G200000 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic006G005200--Sobic009G046900 Sobic006G005200--Sobic003G117800 Sobic004G263500 Sobic004G263500 Sobic006G005200--Sobic004G263500 Sobic007G087000 Sobic007G087000 Sobic008G116700--Sobic007G087000 Sobic008G116700--Sobic002G200000 Sobic008G116700--Sobic001G114200 Sobic002G079000 Sobic002G079000 Sobic008G116700--Sobic002G079000 Sobic002G076500 Sobic002G076500 Sobic008G116700--Sobic002G076500 Sobic009G107300 Sobic009G107300 Sobic008G116700--Sobic009G107300 Sobic008G116700--Sobic007G076400 Sobic008G069300 Sobic008G069300 Sobic008G116700--Sobic008G069300 Sobic004G198600 Sobic004G198600 Sobic008G116700--Sobic004G198600 Sobic003G405600--Sobic003G117800 Sobic007G077532 Sobic007G077532 Sobic003G405600--Sobic007G077532 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic003G405600--Sobic001G257800 Sobic003G405600--Sobic001G114200 Sobic003G405600--Sobic006G060000 Sobic003G405600--Sobic007G030100 Sobic010G213500 Sobic010G213500 Sobic003G405600--Sobic010G213500 Sobic007G172700 Sobic007G172700 Sobic003G405600--Sobic007G172700 Sobic003G405600--Sobic008G055500 Sobic002G200000--Sobic006G060000 Sobic002G200000--Sobic007G076400 Sobic002G200000--Sobic008G116700 Sobic001G141400 Sobic001G141400 Sobic002G200000--Sobic001G141400 Sobic006G115100 Sobic006G115100 Sobic002G200000--Sobic006G115100 Sobic002G200000--Sobic008G055500 Sobic002G200000--Sobic007G172700 Sobic002G200000--Sobic007G087000 Sobic002G355800 Sobic002G355800 Sobic002G200000--Sobic002G355800 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic003G402800--Sobic003G385300 Sobic003G402800--Sobic001G257800 Sobic003G402800--Sobic008G055500 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G402800--Sobic002G074800 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic003G402800--Sobic005G048500 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic003G402800--Sobic005G185500 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic003G402800--Sobic004G064200 Sobic003G402800--Sobic009G046900 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic003G402800--Sobic001G149000 Sobic005G090200--Sobic003G117800 Sobic005G090200--Sobic003G394500 Sobic005G090200--Sobic008G055500 Sobic001G057400 Sobic001G057400 Sobic005G090200--Sobic001G057400 Sobic010G112600 Sobic010G112600 Sobic005G090200--Sobic010G112600 Sobic005G090200--Sobic006G060000 Sobic005G090200--Sobic004G350700 Sobic005G090200--Sobic003G402800 Sobic005G090200--Sobic005G185500 Sobic008G055500--Sobic003G402800 Sobic008G055500--Sobic006G060000 Sobic008G055500--Sobic004G350700 Sobic008G055500--Sobic003G385300 Sobic008G055500--Sobic003G117800 Sobic008G055500--Sobic001G257800 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic008G055500--Sobic008G152700 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic008G055500--Sobic004G176200 Sobic001G501900 Sobic001G501900 Sobic008G055500--Sobic001G501900
Octagon: transcription factors


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