Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G116700.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PEM0
Pfam -
Panther DB PTHR15117
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g35060.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054363
Brachypodium KQJ86482
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G087000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01792: glucose-6-phosphate 1-epimerase
2 Sobic.002G200000 zinc finger, C3HC4 type, putative, expressed -
3 Sobic.001G114200 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
4 Sobic.002G079000 expressed protein -
5 Sobic.002G076500 protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
6 Sobic.009G107300 3\'-5\' exonuclease, putative, expressed -
7 Sobic.007G076400 expressed protein -
8 Sobic.008G069300 - -
9 Sobic.004G198600 cyclin G-associated kinase, putative, expressed K08853: AP2-associated kinase
10 Sobic.009G046900 N-acetylglucosaminyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.007G172700 ECT5, putative, expressed -
12 Sobic.009G156100 - -
13 Sobic.002G069000 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G433400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
15 Sobic.006G060000 CDP-alcohol phosphatidyltransferase, putative, expressed K00999: CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase
16 Sobic.007G153500 metal cation transporter, putative, expressed K14713: SLC39A7, KE4, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7
17 Sobic.003G428000 expressed protein -
18 Sobic.003G198900 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
19 Sobic.002G348400 adenylyl-sulfate kinase, putative, expressed K00860: adenylylsulfate kinase
20 Sobic.003G377500 OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic007G087000 Sobic007G087000 Sobic008G116700--Sobic007G087000 Sobic002G200000 Sobic002G200000 Sobic008G116700--Sobic002G200000 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic008G116700--Sobic001G114200 Sobic002G079000 Sobic002G079000 Sobic008G116700--Sobic002G079000 Sobic002G076500 Sobic002G076500 Sobic008G116700--Sobic002G076500 Sobic009G107300 Sobic009G107300 Sobic008G116700--Sobic009G107300 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic008G116700--Sobic007G076400 Sobic008G069300 Sobic008G069300 Sobic008G116700--Sobic008G069300 Sobic004G198600 Sobic004G198600 Sobic008G116700--Sobic004G198600 Sobic007G087000--Sobic002G079000 Sobic007G087000--Sobic007G076400 Sobic002G306100 Sobic002G306100 Sobic007G087000--Sobic002G306100 Sobic007G087000--Sobic008G116700 Sobic006G250800 Sobic006G250800 Sobic007G087000--Sobic006G250800 Sobic001G014200 Sobic001G014200 Sobic007G087000--Sobic001G014200 Sobic001G237600 Sobic001G237600 Sobic007G087000--Sobic001G237600 Sobic007G172700 Sobic007G172700 Sobic007G087000--Sobic007G172700 Sobic007G087000--Sobic009G107300 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic002G200000--Sobic006G060000 Sobic002G200000--Sobic007G076400 Sobic002G200000--Sobic008G116700 Sobic001G141400 Sobic001G141400 Sobic002G200000--Sobic001G141400 Sobic006G115100 Sobic006G115100 Sobic002G200000--Sobic006G115100 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic002G200000--Sobic008G055500 Sobic002G200000--Sobic007G172700 Sobic002G200000--Sobic007G087000 Sobic002G355800 Sobic002G355800 Sobic002G200000--Sobic002G355800 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic001G114200--Sobic004G350700 Sobic001G114200--Sobic006G060000 Sobic010G160300 Sobic010G160300 Sobic001G114200--Sobic010G160300 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic001G114200--Sobic003G117800 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic001G114200--Sobic003G394500 Sobic006G210700 Sobic006G210700 Sobic001G114200--Sobic006G210700 Sobic001G490900 Sobic001G490900 Sobic001G114200--Sobic001G490900 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic001G114200--Sobic007G030100 Sobic007G218600 Sobic007G218600 Sobic001G114200--Sobic007G218600 Sobic002G079000--Sobic007G087000 Sobic010G169900 Sobic010G169900 Sobic002G079000--Sobic010G169900 Sobic010G213500 Sobic010G213500 Sobic002G079000--Sobic010G213500 Sobic002G079000--Sobic004G198600 Sobic006G128100 Sobic006G128100 Sobic002G079000--Sobic006G128100 Sobic002G079000--Sobic006G250800 Sobic002G079000--Sobic007G172700 Sobic002G079000--Sobic001G237600 Sobic002G079000--Sobic001G490900 Sobic007G153500 Sobic007G153500 Sobic002G076500--Sobic007G153500 Sobic002G076500--Sobic008G116700 Sobic003G432800 Sobic003G432800 Sobic002G076500--Sobic003G432800 Sobic002G322400 Sobic002G322400 Sobic002G076500--Sobic002G322400 Sobic002G076500--Sobic006G210700 Sobic008G019532 Sobic008G019532 Sobic002G076500--Sobic008G019532 Sobic005G087300 Sobic005G087300 Sobic002G076500--Sobic005G087300 Sobic004G172500 Sobic004G172500 Sobic002G076500--Sobic004G172500 Sobic001G051400 Sobic001G051400 Sobic002G076500--Sobic001G051400 Sobic009G228000 Sobic009G228000 Sobic009G107300--Sobic009G228000 Sobic009G107300--Sobic007G087000 Sobic004G240400 Sobic004G240400 Sobic009G107300--Sobic004G240400 Sobic009G107300--Sobic008G116700 Sobic003G043000 Sobic003G043000 Sobic009G107300--Sobic003G043000 Sobic009G107300--Sobic004G198600 Sobic003G120300 Sobic003G120300 Sobic009G107300--Sobic003G120300 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic009G107300--Sobic003G181700 Sobic001G156900 Sobic001G156900 Sobic009G107300--Sobic001G156900 Sobic002G084800 Sobic002G084800 Sobic007G076400--Sobic002G084800 Sobic007G076400--Sobic002G200000 Sobic007G076400--Sobic007G087000 Sobic007G076400--Sobic002G079000 Sobic007G076400--Sobic008G116700 Sobic007G076400--Sobic006G250800 Sobic007G076400--Sobic006G060000 Sobic001G188400 Sobic001G188400 Sobic007G076400--Sobic001G188400 Sobic007G076400--Sobic006G115100 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic008G069300--Sobic009G046900 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic008G069300--Sobic002G074800 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic008G069300--Sobic003G428000 Sobic009G148600 Sobic009G148600 Sobic008G069300--Sobic009G148600 Sobic010G109800 Sobic010G109800 Sobic008G069300--Sobic010G109800 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic008G069300--Sobic009G229400 Sobic003G198900 Sobic003G198900 Sobic008G069300--Sobic003G198900 Sobic009G156800 Sobic009G156800 Sobic008G069300--Sobic009G156800 Sobic006G270000 Sobic006G270000 Sobic008G069300--Sobic006G270000 Sobic004G198600--Sobic002G079000 Sobic004G198600--Sobic004G240400 Sobic010G068700 Sobic010G068700 Sobic004G198600--Sobic010G068700 Sobic004G198600--Sobic007G087000 Sobic004G198600--Sobic009G107300 Sobic004G198600--Sobic001G014200 Sobic004G198600--Sobic002G355800 Sobic004G198600--Sobic010G169900 Sobic004G198600--Sobic008G116700
Octagon: transcription factors


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